应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【求助/交流】如何生成.phy比对文件
51/1返回列表
查看: 1642  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

pitty595

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】如何生成.phy比对文件 已有3人参与

我一般都用在线的clusterw比对，选择输出为phylip文件可以生成.phy文件，但是序列多时（>500条DNA序列）clusterw运行不出来，请问有其他软件或者办法能比对大的文件（超过1000条序列）生成.phy吗？急求！谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-08-14 14:03:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
不知道bioedit可不可以……不过，大于1000条就不行了？是不是机器的问题啊……
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-08-14 18:16:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ottolzm

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
用Phylip 软件试试 应该可以 只不过运行时间比较长  呵呵
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2010-08-15 07:58:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pitty595

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by ottolzm at 2010-08-15 07:58:59:
用Phylip 软件试试 应该可以 只不过运行时间比较长  呵呵

phylip是个软件包啊？里面具体是那个软件程序？
赞一下 回复此楼
4楼2010-08-15 22:05:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ottolzm

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
用dnacomp试试  这是个做dna分子序列的 如果不行 就用单机版本的 clusterw 2.03 试试
下载地址：   
   ftp-igbmc.u-strasbg.fr
    ftp.embl-heidelberg.de
    ftp.ebi.ac.uk
我最多做过50条DNA 序列的比对，至于1000条的 我还没见过，只是软件介绍说有这个功能 你可以尝试一下
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2010-08-15 22:31:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 pitty595 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭