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pitty595

铜虫 (小有名气)

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专业: 环境微生物学

[交流] 【求助/交流】如何生成.phy比对文件已有3人参与

我一般都用在线的clusterw比对，选择输出为phylip文件可以生成.phy文件，但是序列多时（>500条DNA序列）clusterw运行不出来，请问有其他软件或者办法能比对大的文件（超过1000条序列）生成.phy吗？急求！谢谢！

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1楼 2010-08-14 14:03:51

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ottolzm

木虫 (正式写手)

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专业: 微生物生理与生物化学

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流

用dnacomp试试这是个做dna分子序列的如果不行就用单机版本的 clusterw 2.03 试试
下载地址：
ftp-igbmc.u-strasbg.fr
ftp.embl-heidelberg.de
ftp.ebi.ac.uk
我最多做过50条DNA 序列的比对，至于1000条的我还没见过，只是软件介绍说有这个功能你可以尝试一下