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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】如何构建系统更发育树
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reasonspare

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
silicare(金币+1):谢谢参与~ 2010-08-25 12:37:47
w我看了一下该网站：应该说还是不错，因为如果你稍微懂点perl，你就能到ncbi 夏在所有的16S 甚至专门下载模式菌株的 16S, 所以说对于初学者，或者不求甚解（不求甚解在这里解释为：如果连试验菌株所在属的其他模式菌株都不知道，你还知道什么？那你进行菌株鉴定的意义又是什么，哈哈，开个玩笑）的人，完全可以通过这个网站进行分析。
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大慈大悲观世音救苦救难观世音有求必应观世音普渡众生观世音千手千眼观世音官大敢管观世音无处不在观世音普观普长观世音南无观世音菩萨
11楼2010-08-25 10:22:06
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hunter3401

新虫 (小有名气)
★
silicare(金币+1):谢谢分享 2010-08-27 12:07:10
[quote]Originally posted by jndxmmc at 2010-08-25 08:35:13:
模式株很多 有些文献都有注明 菌保中心这方面的资料很全 [/
能给个链接吗？谢谢！
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12楼2010-08-25 17:36:27
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微笑漩涡

新虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 05243003 at 2010-08-25 08:59:56:
NCBI里好多都是无效种，做16S的话建议到韩国EzTaxon Server Version 2.1 里去找相似性的菌株，里边都是已发表的典型菌株。

10楼的这个是正道，顶一下。
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13楼2010-08-25 18:02:04
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千里千寻5801

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
支持楼上的。
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时间蹉跎了我的青春，却也见证了你我的经历！好好珍惜时间，珍惜自己！
14楼2010-08-26 16:23:41
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pxf983621

铁杆木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
共同学习一下。
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15楼2010-08-26 17:16:29
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jndxmmc

新虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by hunter3401 at 2010-08-25 17:36:27:
[quote]Originally posted by jndxmmc at 2010-08-25 08:35:13:
模式株很多 有些文献都有注明 菌保中心这方面的资料很全 [/
能给个链接吗？谢谢！

10楼正解啊
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16楼2010-08-27 09:25:06
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魔理沙中尉

铜虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by jndxmmc at 2010-08-11 11:17:29
先去NCBI下载相似性高的序列 其实你做之前就基本确定菌的种属了，下载模式株也行，然后Clustx进行多序列比对，将比对的结果MEGA分析，构建系统发育数就ok了

请问，一个菌的模式菌株怎么查到啊，老师让我做一株木霉的进化树，他说每一个分支都要用模式菌株，但我不知道在哪里查每个菌株的模式菌株
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17楼2017-11-10 16:53:25
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