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糊涂仙8889

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】求助SSR引物开发方法 已有3人参与

求助SSR引物开发方法,请详细介绍一种或多种SSR引物的开发方法,本人在这方面是菜鸟,越详细越好。必有大量金币回报,非常感谢!
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yujiaping1

木虫 (著名写手)

糊涂仙8889(金币+1):非常感谢 2010-08-07 20:14:58
引用回帖:
Originally posted by 糊涂仙8889 at 2010-08-06 19:46:57:

比如说用BAC文库或EST来开发大批量的SSR引物,可详细说明方法和使用的软件或网址。
非常感谢!

那就用SSRhunter软件搜索SSR序列,然后用Primer5设计引物就行了
5楼2010-08-06 20:46:08
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yujiaping1

木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
看天(金币+1):谢谢回答 2010-08-05 20:09:19
糊涂仙8889(金币+2):感谢参与 2010-08-06 19:48:56
楼主实验的目的是什么?
引物开发方法很多,最简单的搜索库序列,找到微卫星后设计引物,其余的就复杂了,磁珠富集法、ISSR法等,有的需要建库,有的不需要,但是都不简单。
3楼2010-08-05 19:33:06
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小虫宋伟栓

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
要从NCBI网站中找到EST序列,再用primer软件设计吧,可以参考一下
6楼2012-02-10 10:17:40
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