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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 量化图形可视化软件 » 【求助】用Molekel作分子轨道图
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lsc84

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】用Molekel作分子轨道图 已有2人参与

ADF计算得到的结果，应用Densf辅助程序计算，得到一个TAPE41文件，用Molekel打开，能看到分子结构，但是Molekel的Surfaces选项下的Grid Data子选项是灰色的，不能选择，不能作出分子轨道图。不知道错在哪里 ? 谢谢高手指点！
    Densf的输入如下：
#! /bin/sh

$ADFBIN/densf << eor
density scf ortho frag
fitdensity scf ortho frag
orbitals scf
alpha
A 81
end
coulpot frag ortho scf
grid
  -7.5 -7.5 -7.5 -7.5
51 51 51
1.0  0.0  0.0  20.00
0.0  1.0  0.0  20.00
0.0  0.0  1.0  20.00
end
end input
eor

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-8-3 at 10:16 ]
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1楼 2010-08-02 19:05:17
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上
★ ★
lsc84(金币+1):谢谢参与
heyo_123(金币+1):鼓励交流！！！ 2010-08-03 08:20:13
lsc84(金币+4):我需要作的不是HOMO和LUMO分子轨道，是较内层的一个特定的分子轨道，用Windows版本的来作图好像做不出来。希望高手指点！ 2010-08-03 09:39:10
不是直接可以用ADF的GUI作图吗？非要整得这么麻烦啊。
赞一下(2人) 回复此楼
前途光明，出路难觅！
2楼2010-08-03 07:37:15
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lsc84

铁杆木虫 (著名写手)
我需要作的不是HOMO和LUMO分子轨道，是较内层的一个特定的分子轨道，用Windows版本的来作图好像做不出来。希望高手指点！
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3楼2010-08-03 09:38:30
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上
★
lsc84(金币+5):用ADFVIEW打不开，当选择打开t41文件时ADFVIEW窗口就马上关闭了，不知道是什么原因？ 2010-08-03 15:07:09
heyo_123(金币+1):鼓励交流！！！ 2010-08-03 15:25:39
你用ADFVIEW打开t41文件不行？
赞一下(1人) 回复此楼
前途光明，出路难觅！
4楼2010-08-03 12:36:48
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lsc84

铁杆木虫 (著名写手)
用ADFVIEW打不开，当选择打开t41文件时ADFVIEW窗口就马上关闭了，不知道是什么原因？
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5楼2010-08-03 15:06:26
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lsc84

铁杆木虫 (著名写手)

期待高手帮助！
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6楼2010-08-06 16:04:06
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lsc84

铁杆木虫 (著名写手)
7楼2010-08-29 18:15:18
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lsc84

铁杆木虫 (著名写手)
是没有人知道？还是没有人用过？
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8楼2010-08-29 19:54:58
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kcy87123777

新虫 (小有名气)
★
lsc84(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
8楼: Originally posted by lsc84 at 2010-08-29 19:54:58
是没有人知道？还是没有人用过？

你好，我现在也要做分子轨道图，我是将Ms计算的结构导入到Molekel软件的，不管是Molekel4.3还是5.3版本的，但是Molekel的Surfaces选项下的Grid Data子选项是灰色的，不能选择，不能作出分子轨道图。请问你现在能解决吗？谢谢，打扰你！
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守得云开见月明
9楼2013-11-20 10:22:18
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