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lsc84

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】用Molekel作分子轨道图 已有2人参与

ADF计算得到的结果,应用Densf辅助程序计算,得到一个TAPE41文件,用Molekel打开,能看到分子结构,但是Molekel的Surfaces选项下的Grid Data子选项是灰色的,不能选择,不能作出分子轨道图。不知道错在哪里 ? 谢谢高手指点!
    Densf的输入如下:
#! /bin/sh

$ADFBIN/densf << eor
density scf ortho frag
fitdensity scf ortho frag
orbitals scf
alpha
A 81
end
coulpot frag ortho scf
grid
  -7.5 -7.5 -7.5 -7.5
51 51 51
1.0  0.0  0.0  20.00
0.0  1.0  0.0  20.00
0.0  0.0  1.0  20.00
end
end input
eor

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-8-3 at 10:16 ]
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上

★ ★
lsc84(金币+1):谢谢参与
heyo_123(金币+1):鼓励交流!!! 2010-08-03 08:20:13
lsc84(金币+4):我需要作的不是HOMO和LUMO分子轨道,是较内层的一个特定的分子轨道,用Windows版本的来作图好像做不出来。希望高手指点! 2010-08-03 09:39:10
不是直接可以用ADF的GUI作图吗?非要整得这么麻烦啊。
前途光明,出路难觅!
2楼2010-08-03 07:37:15
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lsc84

铁杆木虫 (著名写手)

我需要作的不是HOMO和LUMO分子轨道,是较内层的一个特定的分子轨道,用Windows版本的来作图好像做不出来。希望高手指点!
3楼2010-08-03 09:38:30
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上


lsc84(金币+5):用ADFVIEW打不开,当选择打开t41文件时ADFVIEW窗口就马上关闭了,不知道是什么原因? 2010-08-03 15:07:09
heyo_123(金币+1):鼓励交流!!! 2010-08-03 15:25:39
你用ADFVIEW打开t41文件不行?
前途光明,出路难觅!
4楼2010-08-03 12:36:48
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lsc84

铁杆木虫 (著名写手)

用ADFVIEW打不开,当选择打开t41文件时ADFVIEW窗口就马上关闭了,不知道是什么原因?
5楼2010-08-03 15:06:26
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lsc84

铁杆木虫 (著名写手)


期待高手帮助!
6楼2010-08-06 16:04:06
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lsc84

铁杆木虫 (著名写手)

7楼2010-08-29 18:15:18
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lsc84

铁杆木虫 (著名写手)

是没有人知道?还是没有人用过?
8楼2010-08-29 19:54:58
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kcy87123777

新虫 (小有名气)


lsc84(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
8楼: Originally posted by lsc84 at 2010-08-29 19:54:58
是没有人知道?还是没有人用过?

你好,我现在也要做分子轨道图,我是将Ms计算的结构导入到Molekel软件的,不管是Molekel4.3还是5.3版本的,但是Molekel的Surfaces选项下的Grid Data子选项是灰色的,不能选择,不能作出分子轨道图。请问你现在能解决吗?谢谢,打扰你!
守得云开见月明
9楼2013-11-20 10:22:18
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