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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 量化新手直通车 » 【求助】如何看分子轨道图
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xbrare

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】如何看分子轨道图 已有8人参与

我是GAUSSIAN初学者，目前正在学习，但现在困扰我的问题是如何看一张分子轨道图谱，如何辨别是什么键什么原子之间的作用力，那位高手能指点一下，最好有本好书能让我茅塞顿开。多谢各位了！
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1楼 2010-06-05 20:41:06
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
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aylayl08(金币+2):谢谢提示 2010-06-09 17:57:31
引用回帖:
Originally posted by Miracle922 at 2010-06-09 10:48:47:
你好！不知能否讨论下关于分子轨道的问题，我前几天也发过一个帖子，做分子轨道分析时候，当然我是想得到具体的原子轨道对某个MO的贡献，[url]http://blog.163. ...

你给的链接打不开，我找到你的帖子，是这个吧？
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2124528
你原文
引用回帖:
在6-311+G(d)基组下，用pop=full得到molecular orbital coefficients，如下所示：
1  Al  1S        
2        2S      
3        3S      
4        4S      
5        5S      
6        6S      
7        7PX   
8        7PY   
9        7PZ     
10        8PX   
11        8PY   
12        8PZ   
13        9PX   
14        9PY   
15        9PZ   
16       10PX  
17       10PY  
18       10PZ   
19       11PX  
20       11PY  
21       11PZ   
22       12S     
23       12PX  
24       12PY  
25       12PZ   
26       13D 0  
27       13D+1
28       13D-1
29       13D+2
30       13D-2

首先，你要从高斯中文手册中（P33）得知，6-311基组对于金属Al在高斯使用的是MacLean-Chandler 的(12s,9p)—>(621111,52111)基组，参考文献为高斯的328/329号文献，然后去检索该文献，可以得到对应的基组的分配。直接给你结果，你应该能看懂，
1  Al  1S       | =》
2        2S      |=》前面这两个对应1S轨道
3        3S  |=>     
4        4S  |=>紧接着这两个对应2S轨道   
5        5S    ------->   
6        6S    ------->这两个对应3S轨道   
7        7PX     |=》
8        7PY     |=》
9        7PZ     |=》
10        8PX   |=》
11        8PY   |=》
12        8PZ   |=》这六个对应2P的轨道
13        9PX   ------>
14        9PY   ------>
15        9PZ   ------>
16       10PX  ------>
17       10PY  ------>
18       10PZ  ------>
19       11PX  ------>
20       11PY  ------>
21       11PZ  ------>这九个对应3P轨道
22       12S     |=》这就是你那个加号带来的弥散轨道，对应4S轨道
23       12PX   |----->
24       12PY  |----->
25       12PZ   |----->这三个是弥散出来的p轨道，也就是4P轨道
26       13D 0  
27       13D+1
28       13D-1
29       13D+2
30       13D-2  这几个不用解释了，就是你那个(d)添加的极化轨道，也就是3d轨道

另一个金属Ti的，也按这个方法，先去找原始文献，然后对应。今天来不及了，要接小孩放学了，以后再说吧。
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一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
10楼2010-06-09 16:16:49
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普通回帖

250260882

木虫 (正式写手)
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我只会画HOMO和LUMO
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2楼2010-06-07 09:03:41
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marisa_alice

新虫 (初入文坛)
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话说用gaussview不就可以看了……
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3楼2010-06-07 19:11:57
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
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aylayl08(金币+3):谢谢 2010-06-09 17:57:08
简单的说，补充一下价键理论就差不多了。
常见的化学键无非是离子键或者共价键，在有机化学里，多数按共价键来描述。
两个原子轨道的相位相同为成键，相位相反为反键。
西格玛键σ是两个原子轨道头碰头的成键，主要是s轨道、p轨道以及dz^2轨道，
派键π是两个原子轨道肩并肩的方式成键，主要是p轨道和d轨道，
德塔δ键是两个原子轨道面对面的方式，主要是d轨道的面重合。
至于是s轨道还是p轨道亦或是d轨道，就看形状即可，s轨道是球形的，p轨道是纺锤形的，d轨道是十字交叉的纺锤形（dz^2例外，是纺锤形围上一圈反相的轨道）。
至于是哪个原子的轨道，看位置啊，离哪个原子最近就是谁提供的——这是从图上看，也可以看轨道波函数，看系数……
自己做几个简单的例子，练习几次就会了。。。
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4楼2010-06-07 19:26:47
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zongwww

金虫 (正式写手)
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引用回帖:
Originally posted by zhangmt at 2010-06-07 19:26:47:
简单的说，补充一下价键理论就差不多了。
常见的化学键无非是离子键或者共价键，在有机化学里，多数按共价键来描述。
两个原子轨道的相位相同为成键，相位相反为反键。
西格玛键σ是两个原子轨道头碰头的成键， ...

谢谢您的回复，但怎么从轨道波函数来看分子轨道图形呢？我看分子轨道图形图形感觉就像在猜，好像是又好像不是，有什么具体步骤吗？
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5楼2010-06-08 16:30:09
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zhangmt

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aylayl08(金币+3):谢谢提示 2010-06-09 17:57:17
从波函数看图形？这个你看不出来的，可以用gview把MO画出来你才能看。
从波函数中不同原子的不同轨道的系数，大致能看出哪个轨道占主要成分，如果做NBO分析，可以给出比较明确的百分比——不过那只是定域化以后的数字，而我们知道分子轨道理论中，电子是离域而非定域的。所以结论只能供参考。
大一些的复杂分子，由于电子是全分子内离域的，不可能是定域在两个原子之间的，所以图形会复杂得很。因为分子轨道理论和价键理论是两种理论，只不过价键理论更简单直观，容易被实验化学家理解和接受，所以理论化学家试图将的分子轨道理论的计算结果用价键理论去描述出来，就好像用一堆长方形拼出圆形来，实在只好是勉为其难的。大致上做局部的示意罢了，不可能一一对应的。

[ Last edited by zhangmt on 2010-6-8 at 20:22 ]
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6楼2010-06-08 20:17:16
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zongwww

金虫 (正式写手)
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谢谢！我还有一个问题，我在做Gaussian计算时，屏幕显示停留在某一步很长时间还不动，我不知道是算不下去了还是什么？
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7楼2010-06-09 10:45:21
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Miracle922

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Originally posted by zhangmt at 2010-06-07 19:26:47:
简单的说，补充一下价键理论就差不多了。
常见的化学键无非是离子键或者共价键，在有机化学里，多数按共价键来描述。
两个原子轨道的相位相同为成键，相位相反为反键。
西格玛键σ是两个原子轨道头碰头的成键， ...

你好！不知能否讨论下关于分子轨道的问题，我前几天也发过一个帖子，做分子轨道分析时候，当然我是想得到具体的原子轨道对某个MO的贡献，下面有个网址，可能跟我的疑问很相似了：
http://blog.163.com/wangshuai_cs ... 496392008019490783/

就是它标示出来轨道的贡献了，但是我如果想归属3pxz之类属于哪个原子轨道的，就有点说不清楚；不知道你是否注意过这个问题，还是通过别的方法解决 谢谢！
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做到极致，做到细处
8楼2010-06-09 10:48:47
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zongwww

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我在做关于Zr的计算，但屏幕上时不时出现“defaulting to unpruned grid for atomic number 40",然后过了一段时间就会蹦出错误提示”the processing of last link ended anbormal",到底怎么了，我是新手，望高人指点。
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9楼2010-06-09 15:18:19
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