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sungl07

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】如何计算结合自由能 已有6人参与

DS能计算么?
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雪狼乖乖

木虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
计算什么体系结合能?希望能叙述清楚。
2楼2010-07-28 21:06:34
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
雪狼乖乖(金币+1):谢谢 2010-07-31 03:29:10
又是一个惜字如金的主儿,帮助者都需要揣摩被帮者的意图才行。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
3楼2010-07-29 07:45:47
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sungl07

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 雪狼乖乖 at 2010-07-28 21:06:34:
计算什么体系结合能?希望能叙述清楚。

用于小分子配体和受体亲和力的评价,进行相关定量分析
4楼2010-07-29 11:20:18
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zhuangshl

银虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-07-29 13:58:41

用于小分子配体和受体亲和力的评价,进行相关定量分析

当然可以
5楼2010-07-29 13:03:39
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sungl07

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by zhuangshl at 2010-07-29 13:03:39:

用于小分子配体和受体亲和力的评价,进行相关定量分析

当然可以

那如何操作,请赐教!
6楼2010-07-29 21:15:50
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superdirac

木虫 (正式写手)


雪狼乖乖(金币+1):谢谢 2010-07-31 03:29:42
生物体系 or 化学体系?
  那namd中的ABF,FEP都可以用来算这个东西。
我认为,酒一口一口喝,路一步一步走~步子迈大了,喀~容易扯着蛋
7楼2010-07-30 16:39:38
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sungl07

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by superdirac at 2010-07-30 16:39:38:
生物体系 or 化学体系?
  那namd中的ABF,FEP都可以用来算这个东西。

化学体系,DS能算吗?
8楼2010-07-31 11:17:42
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xingyanfei

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
926852楼: Originally posted by superdirac at 2010-07-30 16:39:38
生物体系 or 化学体系?
  那namd中的ABF,FEP都可以用来算这个东西。

请问 ABF FEP PMF他们在计算的体系有什么差别,或是有什么要求!!三种计算方法的差别,求教!!!!!
00fei00fei00fei00fei00fei00
9楼2012-10-29 15:20:27
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superdirac

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-10-29 20:16:33
引用回帖:
2468815楼: Originally posted by xingyanfei at 2012-10-29 15:20:27
请问 ABF FEP PMF他们在计算的体系有什么差别,或是有什么要求!!三种计算方法的差别,求教!!!!!...

pmf:是指自由能曲线.
abf: 是一种计算自由能曲线的方法。
FEP: 是一种计算两个态之间自由能差值的方法。
我认为,酒一口一口喝,路一步一步走~步子迈大了,喀~容易扯着蛋
10楼2012-10-29 15:37:51
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