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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【求助】如何计算结合自由能
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sungl07

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】如何计算结合自由能 已有6人参与

DS能计算么？
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1楼 2010-07-28 11:55:35
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雪狼乖乖

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
计算什么体系结合能？希望能叙述清楚。
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2楼2010-07-28 21:06:34
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
雪狼乖乖(金币+1):谢谢 2010-07-31 03:29:10
又是一个惜字如金的主儿，帮助者都需要揣摩被帮者的意图才行。
赞一下(2人) 回复此楼
除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
3楼2010-07-29 07:45:47
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sungl07

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 雪狼乖乖 at 2010-07-28 21:06:34:
计算什么体系结合能？希望能叙述清楚。

用于小分子配体和受体亲和力的评价，进行相关定量分析
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4楼2010-07-29 11:20:18
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zhuangshl

银虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-07-29 13:58:41
》
用于小分子配体和受体亲和力的评价，进行相关定量分析

当然可以
赞一下(2人) 回复此楼
5楼2010-07-29 13:03:39
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sungl07

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhuangshl at 2010-07-29 13:03:39:
》
用于小分子配体和受体亲和力的评价，进行相关定量分析

当然可以

那如何操作，请赐教！
赞一下 回复此楼
6楼2010-07-29 21:15:50
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superdirac

木虫 (正式写手)
★
雪狼乖乖(金币+1):谢谢 2010-07-31 03:29:42
生物体系　or 化学体系？
　　那namd中的ABF,FEP都可以用来算这个东西。
赞一下(1人) 回复此楼
我认为，酒一口一口喝，路一步一步走~步子迈大了，喀~容易扯着蛋
7楼2010-07-30 16:39:38
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sungl07

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by superdirac at 2010-07-30 16:39:38:
生物体系　or 化学体系？
　　那namd中的ABF,FEP都可以用来算这个东西。

化学体系，DS能算吗？
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8楼2010-07-31 11:17:42
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xingyanfei

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
926852楼: Originally posted by superdirac at 2010-07-30 16:39:38
生物体系　or 化学体系？
　　那namd中的ABF,FEP都可以用来算这个东西。

请问 ABF FEP PMF他们在计算的体系有什么差别，或是有什么要求！！三种计算方法的差别，求教！！！！！
赞一下 回复此楼
00fei00fei00fei00fei00fei00
9楼2012-10-29 15:20:27
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superdirac

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-10-29 20:16:33
引用回帖:
2468815楼: Originally posted by xingyanfei at 2012-10-29 15:20:27
请问 ABF FEP PMF他们在计算的体系有什么差别，或是有什么要求！！三种计算方法的差别，求教！！！！！...

pmf:是指自由能曲线．
abf: 是一种计算自由能曲线的方法。
FEP: 是一种计算两个态之间自由能差值的方法。
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我认为，酒一口一口喝，路一步一步走~步子迈大了，喀~容易扯着蛋
10楼2012-10-29 15:37:51
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