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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】PCR鉴定的片段长度
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red99smile

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】PCR鉴定的片段长度 已有5人参与

各位前辈们好啊，PCR扩增法鉴定微生物的基因时，片段的长短有特别的习惯或规定吗？大概多少BP啊？    谢谢啦~~
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1楼 2010-07-19 00:01:17
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zhaohq1209

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
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看天(金币+1):鼓励交流 2010-07-19 12:59:25
鉴定微生物的特异基因还是毒力基因呢？一般能用琼脂糖电泳区分就可以了，没有什么特殊的要求。如果是做16s，那就不能太长，由于需要测序，所以产物最好能在一个反应中或者双向测通，一般1000bp左右合适。
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我有一个梦想，我梦想有一天，我们的人民可以根据自己的意愿与消费能力，居住在自己愿意居住的地方。
4楼2010-07-19 10:15:18
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molecula

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
1949stone(金币+3):祝您好梦 这么晚了 可以睡觉了 哈哈 做实验 也要注意身体 2010-07-19 00:14:45
这个要根据你的菌种来定吧

一般来讲   菌种都是在跑16S
根据其特异性和保守性两个方面来鉴定

特异性在于 该菌种与其他菌的差异
保守性在于 该菌种对于其所在菌属的序列保守性

都不知道你要鉴定哪一个  怎么能够给你解答这个问题？
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2楼2010-07-19 00:10:24
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lcx_2008

木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
请将你要鉴定的菌株 描述的详细点
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3楼2010-07-19 06:14:11
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+2):感谢交流，希望对楼主有帮助~~ 2010-07-19 17:58:46
我 的建议是，先看genbank数据库里面相关的基因的长度，因为你想鉴定菌种的基因，肯定是想和网上的比对，有可能还会做树，先看网上别人的序列是多长，你再相应地扩增多长，要是别人的非常短，你弄再长还是要截短，还有，一般来讲越长，越能说明问题……希望对你有帮助……
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5楼2010-07-19 15:41:41
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