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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【其他】vasp neb 计算讨论
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zhangfan2192

金虫 (著名写手)

[交流] 【其他】vasp neb 计算讨论 已有11人参与

希望各位用vasp的虫友能够讨论下neb计算中的注意事项：

不知道为什么，我在用neb计算过度态的时候总是感觉计算结果不是很理想，很难找到自己需要的结果，比如说计算的8个image的能量是单调上升或下降的，而不是抛物线形状，不知道大家在计算的时候遇到这样的情况没，如果遇到的话大家都是怎么解决的？相信现在用vasp软件的不在少数，欢迎大家积极讨论建议！
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相逢是缘！
1楼 2010-07-05 21:46:51
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
★ ★ ★
gavinliu7390(金币+2):谢谢交流！ 2010-07-06 11:25:33
xiaohunhun(金币+1):谢谢 2010-07-06 12:34:51
zhangfan2192(金币+5): 2010-07-06 14:08:52
做NEB要保证初态和末态处于能量极小值点（局域的或是全局的），也就是初态和末态都是经过优化之后的，在这个基础上再做中间的imagines可能就可以避免单调上升和下降了。个人观点，欢迎指正。

[ Last edited by uuv2010 on 2010-7-6 at 10:23 ]
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3楼2010-07-06 10:20:14
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lfhuang

木虫 (著名写手)
★
lvjian8596(金币+1):感谢交流！ 2010-07-07 12:58:39
zhangfan2192(金币+5):谢谢 2010-07-07 20:13:51
为什么LCLIMB=.False.呢？Climbing-Image NEB 能够帮助找到路径中的能量最高点。
还有，如果路径较长，可能还需要增加images 数量来保证路径收敛正确。
再则，如果楼主大概知道反应势垒，并且很小的话，每一个image能量的计算就需要特别精细了，因为一点误差都会导致结果和预期很不一样。
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先进使役材料计算（https://aidme.nimte.ac.cn）
8楼2010-07-07 12:21:50
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tangxiaowei

铁虫 (小有名气)
楼主悲剧啊，我和你一样也遇到同样的问题，也不知道怎么解决。。。
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18楼2010-11-20 21:29:59
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普通回帖

stractor

金虫 (著名写手)
★ ★
lvjian8596(金币+1):感谢交流！ 2010-07-05 22:38:22
xiaohunhun(金币+1):xiexie 2010-07-06 07:30:38
zhangfan2192(金币+5):谢谢 2010-07-06 09:20:03
能量表现为单调变化有可能出现。如始态和末态的某一个构型不是能量局域极小态的情况。
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2楼2010-07-05 22:16:51
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zhangfan2192

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by uuv2010 at 2010-07-06 10:20:14:
做NEB要保证初态和末态处于能量极小值点（局域的或是全局的），也就是初态和末态都是经过优化之后的，在这个基础上再做中间的imagines可能就可以避免单调上升和下降了。个人观点，欢迎指正。

[ Last edited ...

谢谢回复，我的构型都是经过优化之后才算NEB的，不知道除了能量极小点这个因素外还有没有其他因素。
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相逢是缘！
4楼2010-07-06 14:10:44
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fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)
zhangfan2192(金币+2): 2010-07-07 10:41:12
最好能给出INCAR。
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5楼2010-07-07 10:30:40
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zhangfan2192

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by fanchen021 at 2010-07-07 10:30:40:
最好能给出INCAR。

INCAR文件如下：

   SYSTEM = Sul-Fe
  Startparameter for this Run:
   NWRITE =     2     verbosity write-flag
   LPETIM=      F     write-flag & timer #
   ISTART =     0     0-new 1-cont 2-samecut job
   ISPIN  =     2     1-no, 2-yes
   INIWAV =     1     0-jellium WF; 1-random numbers (recomm.)

  Electronic Relaxation
!   ENCUT  =   400.00   #Ecut (eV)
   PREC   =    Medium  *  #precission: #Low/Medium/High
   NELM   =    200      max. # of electronic SC steps
   NELMDL  =    5      # of non-consistent steps at the beggining:>0 or <0
   EDIFF  = 1.0e-4    stopping-criterion for electronic upd.
   VOSKOWN = 1
   ISMEAR = 1
   SIGMA = 0.1
!   AMIX = 0.2
!   BMIX = 0.0001

  Ionic relaxation
   EDIFFG =  1.0e-3    stopping-conditions for ionic relax.loop (EDIFF*10)
   NSW    =    200      *  # of steps for ionic update (def:0)
   IBRION =    2   *  ionic relax: -1:no move; 0-MD;1-Newton;2-CG;3-damped;4-?
   ISIF   =    2   *  calc.stress:0-no;1-tr;2-7 yes; 3-change vol.4-change shape
   ISYM   =    0      symmetry:0-OFF, 1-ON,2-ON+memory conserving for CD

   POTIM  =   0.3     if IBRION=1,2,3:scaling constant forces;IBRION=0,time st.


   LPLANE = .TRUE.
   NPAR = 8
   IALGO  =   48    * algorithm: use only 8 (CG) or 48 (RMM-DIIS)
   LDIAG  = .TRUE.    sub-space diagonalisation
   GGA    =   91    * xc-type: PB, PW (86), LM, 91 (Perdew-Wang 91)

   LWAVE  =  .F.     * write WAVECAR
   LCHARG =  .T.    * write CHGCAR and CHG
   LVTOT  =  .F.      * write the local potential LOCPOT
   LELF   = .F.   create ELFCAR file
   LORBIT =   .F.      create PROOUT
   LREAL = Auto
! NEB
  IMAGES = 8              ! Number of images in the band, excluding endpoints
  SPRING = -5.0 eV/A2     ! Spring force between images; negative value turns on nudging
  LCLIMB = .False.         ! Flag to turn on the climbing image algorithm
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相逢是缘！
6楼2010-07-07 10:40:56
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nxc0907

★ ★
hometownlove(金币+2):谢谢交流 2010-07-07 12:19:05
zhangfan2192(金币+2):多谢 2010-07-07 20:13:34
还有可能就是：点选取的不合理，真实的过渡态是非常接近末态或初态。
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7楼2010-07-07 12:07:50
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wup123

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhangfan2192 at 2010-07-07 10:40:56:

INCAR文件如下：

   SYSTEM = Sul-Fe
  Startparameter for this Run:
   NWRITE =     2     verbosity write-flag
   LPETIM=      F     write-flag & timer #
   ISTART =     0     0-new 1-co ...

你采用IBRION=2，能很好的收敛吗？我一般使用1，曾用过IBRION=2,当时没收敛。现在我也遇到了和楼主一样的情况，采用8个images，没有势垒。你的问题解决了吗？
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9楼2010-07-12 09:39:04
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wup123

铁虫 (小有名气)
★
gavinliu7390(金币+1):谢谢交流！ 2010-07-12 15:48:52
引用回帖:
Originally posted by lfhuang at 2010-07-07 12:21:50:
为什么LCLIMB=.False.呢？Climbing-Image NEB 能够帮助找到路径中的能量最高点。
还有，如果路径较长，可能还需要增加images 数量来保证路径收敛正确。
再则，如果楼主大概知道反应势垒，并且很小的话，每一个i ...

你说“每一个image能量的计算就需要特别精细了”，你的意思是说算完neb再算自洽？
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10楼2010-07-12 09:43:21
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