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zjm022243

金虫 (正式写手)

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[交流] 【求助】请问这个模型用NAMD怎么画已有4人参与

请问像这样的模型用NAMD或者Hyperchem能画么？有高手能给出个做这种模型的说明或者链接么？

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1楼 2010-07-05 21:36:17

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wally8962

木虫 (著名写手)

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专业: 生物力学

★ ★ ★ ★
zjm022243(金币+2):非常非常感谢！ 2010-07-06 19:22:40
zjm022243(金币+5):谢谢 2010-07-06 19:23:45
ghcacj(金币+4):谢谢 2010-07-07 10:24:12

tcl脚本语言，你google一下，可以看到简单教程。都不一定需要看，可以用来查一些函数

vmd tutorial里面有一些例子，看看就会了

我讲两个你会用到的核心命令

$mol move [trans z 10] #分子坐标绕Z轴旋转10度
$mol moveby {0 0 5} #沿Z轴平移5埃
$mol writepdb a1.pdb #保存一组坐标

用上一些循环，就可以保存下一大堆分子坐标，然后再把它们合并，ok