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vigaryang木虫 (正式写手)
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【讨论】NBO分析中如何判断π相互作用?已有7人参与
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当对分子A和分子B的复合物进行NBO分析时,得到如下的一组轨道相互作用: Donor Acceptor E(2) 161. LP (2) O 35 /991. BD*( 2) N 1 - C 5 0.09 由化学结构式知道N1和C5之间是双键,那么能不能根据上面显示的结果认为A与B之间发生了p-pai相互作用?谢谢。 |
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ter20
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4楼2010-07-03 17:18:37
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2楼2010-07-03 14:20:12
vigaryang
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3楼2010-07-03 14:43:37
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heyo_123(金币+2):鼓励交流!! 2010-07-06 16:31:09
aylayl08(金币+2):谢谢交流 2010-07-07 10:54:19
vigaryang(金币+1):3 2010-07-11 16:36:10
vigaryang(金币+2): 2010-07-11 16:36:22
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vigaryang(金币+1):3 2010-07-11 16:36:10
vigaryang(金币+2): 2010-07-11 16:36:22
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首先NHO和NBO轨道是由不同的方式得到的轨道,一个是自然杂化轨道,一个是自然键轨道。 如果不加特别的关键词我们得到的是NBO轨道的信息。 以NBO轨道为例,如果想知道两个原子间成的是单间还是双键,通过查看NBO分析结果中C和N之间形成了几个BD就可以大概得到,但比较可靠的还是要分析由C1-N5组成的BD的组分,如BD(1)C1-N5是由C1的2s和N5的2s组成的sigma轨道,也可以看出s轨道的%比,当然一般会有部分2p的参与,假定为2px的参与,我们可以得出,BD(1)C1-N5为在px方向上形成的一个sigama键;同样我们可以分析BD(2)C1-N5假定为在2py方向上形成的pi键,也可以得到C1和N5分别的贡献假定前者为67%,后者为33%。 而反键BD*(2)C1-N5则是C1的贡献为33%,N5的贡献为67% 当分析片段间或是分子间的相互作用时,一般NBO会给出一些unit,分析unit之间的相互作用 如一楼想知道A和B之间是否有pi相互作用,那就需要去分析unit之间E(2)值比较大(一般要大于5 kcal/mol)的几个Donor Acceptor 相互作用,看是否有pi键的参与,有时候一个pi键参与了几个相互作用,是可以叠加起来来考虑的。 |
5楼2010-07-06 15:40:12













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