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vigaryang

木虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】NBO分析中如何判断π相互作用? 已有7人参与

当对分子A和分子B的复合物进行NBO分析时,得到如下的一组轨道相互作用:
    Donor                                                  Acceptor                      E(2)
161. LP (2) O  35                /991. BD*(   2) N   1 - C   5            0.09

由化学结构式知道N1和C5之间是双键,那么能不能根据上面显示的结果认为A与B之间发生了p-pai相互作用?谢谢。
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vigaryang

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by qzhaosdu at 2010-07-03 14:20:12:
可以认为是O的孤电子对和N-C的pi反键有相互作用,但是E(2)太小了,这种相互作用可以忽略不计了,这个不能算数的。

谢谢。那么这个“pi”是如何来判定的呢?是通过结构式中有个双键就认定是“pi”呢,还是要通过对NBO输出结果中这一反键轨道的详细轨道组成来判定(比如观察构成这一个反键轨道的两个NHO各自的组成中s轨道占多少,p轨道占多少)?
3楼2010-07-03 14:43:37
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)

★ ★ ★
erylingjet(金币+1):感谢交流! 2010-07-03 17:28:00
zhou2009(金币+2): 2010-07-07 14:12:27
可以认为是O的孤电子对和N-C的pi反键有相互作用,但是E(2)太小了,这种相互作用可以忽略不计了,这个不能算数的。
Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
2楼2010-07-03 14:20:12
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ter20

铁杆木虫 (正式写手)

★
erylingjet(金币+1):感谢交流! 2010-07-03 17:28:06
你可以看一下N-C的BD*反键的轨道构成啊,就在前面杂化的那一部分
4楼2010-07-03 17:18:37
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xiaoma541

银虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
heyo_123(金币+2):鼓励交流!! 2010-07-06 16:31:09
aylayl08(金币+2):谢谢交流 2010-07-07 10:54:19
vigaryang(金币+1):3 2010-07-11 16:36:10
vigaryang(金币+2): 2010-07-11 16:36:22
首先NHO和NBO轨道是由不同的方式得到的轨道,一个是自然杂化轨道,一个是自然键轨道。
如果不加特别的关键词我们得到的是NBO轨道的信息。
以NBO轨道为例,如果想知道两个原子间成的是单间还是双键,通过查看NBO分析结果中C和N之间形成了几个BD就可以大概得到,但比较可靠的还是要分析由C1-N5组成的BD的组分,如BD(1)C1-N5是由C1的2s和N5的2s组成的sigma轨道,也可以看出s轨道的%比,当然一般会有部分2p的参与,假定为2px的参与,我们可以得出,BD(1)C1-N5为在px方向上形成的一个sigama键;同样我们可以分析BD(2)C1-N5假定为在2py方向上形成的pi键,也可以得到C1和N5分别的贡献假定前者为67%,后者为33%。
而反键BD*(2)C1-N5则是C1的贡献为33%,N5的贡献为67%

当分析片段间或是分子间的相互作用时,一般NBO会给出一些unit,分析unit之间的相互作用

如一楼想知道A和B之间是否有pi相互作用,那就需要去分析unit之间E(2)值比较大(一般要大于5 kcal/mol)的几个Donor  Acceptor 相互作用,看是否有pi键的参与,有时候一个pi键参与了几个相互作用,是可以叠加起来来考虑的。
5楼2010-07-06 15:40:12
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