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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】建模问题
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wwgaochao

铜虫 (正式写手)

[交流] 【求助】建模问题 已有3人参与

刚刚接触第一性原理计算，刚刚接触MS，一窍不通...
我在建立硅的64个原子的晶胞后想在Si-Si键间加入一个间隙氧原子，试着通过 ADD ATOM键设定坐标后加入，但加不进去，请问该怎么在Si-Si键间加入间隙氧原子？？？另外，要在模型中构建空位，直接删去一个硅原子可以吗？为了清楚的显示出空位的位置，我想把空位设置成实体原子的形式（颜色不同于Si原子），这个该怎么弄？
请指教一下（问这种低级问题实在惭愧）

[ Last edited by wwgaochao on 2010-6-30 at 14:16 ]
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1楼 2010-06-29 22:05:06
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wwgaochao

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by aylayl08 at 2010-06-30 19:06:32:
难道不是在间隙里加原子吗？怎么说是在Si-Si键间加入？不懂。
构建空位时删个原子就行，空位设置成原子可以换其他原子就行，也可以PS。

谢谢版主
在间隙里加是添加原子时输入坐标吗？但有些位置的坐标该怎么确定？处于间隙位时间隙位的坐标该怎么求？
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3楼2010-06-30 19:53:32
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aylayl08

荣誉版主 (文坛精英)

至尊天蝎

优秀版主
★
zzy870720z(金币+1):谢谢交流 2010-06-30 19:23:18
wwgaochao(金币+2):谢谢版主 2010-06-30 19:53:50
难道不是在间隙里加原子吗？怎么说是在Si-Si键间加入？不懂。
构建空位时删个原子就行，空位设置成原子可以换其他原子就行，也可以PS。
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珍惜拥有，快乐人生!欢迎光临计算模拟区(*^__^*)。。。。。。。。。。。。。。
2楼2010-06-30 19:06:32
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aylayl08

荣誉版主 (文坛精英)

至尊天蝎

优秀版主
★
cenwanglai(金币+1):呵呵,辛苦了 2010-07-01 08:09:07
wwgaochao(金币+6):嗯，好的，谢谢 2010-07-01 11:44:44
引用回帖:
Originally posted by wwgaochao at 2010-06-30 19:53:32:

谢谢版主
在间隙里加是添加原子时输入坐标吗？但有些位置的坐标该怎么确定？处于间隙位时间隙位的坐标该怎么求？

是输入坐标，那就是立体几何的问题了，手动算不难，也有软件可以自动识别空隙的，好像medeA就可以，其他的软件应该也有，你再问问。
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珍惜拥有，快乐人生!欢迎光临计算模拟区(*^__^*)。。。。。。。。。。。。。。
4楼2010-07-01 07:52:50
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guolianshun

铜虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by aylayl08 at 2010-06-30 19:06:32:
难道不是在间隙里加原子吗？怎么说是在Si-Si键间加入？不懂。
构建空位时删个原子就行，空位设置成原子可以换其他原子就行，也可以PS。

大虾说的PS什么意思？空位设置成原子可以换其他原子就行？是不是直接选中一个原子替换，就可以了？我掺杂后优化的结构怎么有的有键有的没键，看上去很混论，呵呵。谢谢大虾。
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5楼2010-07-14 17:24:41
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