24小时热门版块排行榜    

查看: 1719  |  回复: 4
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 jinling158 的 15 个金币

jinling158

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】相对定量可以不做标准曲线吗已有3人参与

本人想做real time PCR, 做测试菌株和参照菌株之间A基因的表达差异,看了很多资料之后,觉得没有必要做标准曲线,原因如下:
目前主要用两种方法进行相对定量,其中之一是2-△△Ct法,该法前提是目的基因和参照基因有相同的扩增效率且接近100%;我认为用这种方法需要做标准曲线来看一下目的基因和参照基因的扩增效率是否相同。
另外一种方法是Pfaffl法,这种方法应用的前提是单个基因(目的基因和参照基因)在试验样本和标准样本中有相同的扩增效率,但不要求目的基因和参照基因有相同的扩增效率。但是用这种方法要知道目的基因和参照基因的扩增效率,请问一下做过的同学,如果不做标准曲线的话怎么知道目的基因和参照基因的扩增效率呢?另外,怎么确定单个基因在不同样本之间具有相同的扩增效率呢?

希望做过的童鞋发表一下您的高见,谢谢!

[ Last edited by jinling158 on 2010-7-2 at 17:37 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kikie

木虫 (正式写手)

★ ★
1949stone(金币+2):谢谢交流 2010-06-29 21:04:33
jinling158(金币+1): 2010-06-30 11:22:17
jinling158(金币+1): 2010-07-02 17:38:02
所以要做,呵呵。
用2-△△Ct分析,先做标准曲线,看该引物在样品中扩增效率是否一致,否则需要调整。
性痴则志凝,故书痴者文必工,艺痴者技必良;世之落拓无成者,皆自谓不痴者也
2楼2010-06-29 20:50:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jinling158

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by kikie at 2010-06-29 20:50:24:
所以要做,呵呵。
用2-△△Ct分析,先做标准曲线,看该引物在样品中扩增效率是否一致,否则需要调整。

我知道用2-△△Ct分析要做标准曲线,我的意思是说Pfall方法用不用做?
3楼2010-06-30 11:23:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

weiyang1386

金虫 (小有名气)

jinling158(金币+1): 2010-07-08 11:04:39
jinling158(金币+1):对的 2010-07-08 11:05:22
jinling158(金币+1): 2010-07-08 11:05:39
这样一般如果不用一楼的做法,貌似还是要用不同浓度的样品做管家基因和样品分别作曲线,即双标发,然后以样品对管家基因的比值来相对定量。
如果说的不对见谅啊!
4楼2010-07-07 18:26:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jinling158

铜虫 (小有名气)

楼上的说得对,我现在已经有思路了,谢谢参与!
5楼2010-07-08 11:06:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jinling158 的主题更新
普通表情 高级回复(可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 我感觉当老师好累啊。。 +21 fairy1122 2024-11-15 22/1100 2024-11-16 16:18 by 769509727
[硕博家园] 硕博人来此 +5 ColonMo 2024-11-16 11/550 2024-11-16 15:59 by ColonMo
[基金申请] 变性人申请基金咋算性别? +22 leicahfs 2024-11-11 22/1100 2024-11-16 15:31 by 竹子宝
[教师之家] 评正教授需要两个国家级项目,有人用子课题糊弄,结果在评审前资格公示时被举报拿下了 +22 瞬息宇宙 2024-11-12 32/1600 2024-11-16 15:24 by bingyulin3
[考博] 联系的博导说有时间聊一聊 我回复了自己可以的时间后 博导就没再回复 +7 evan0489 2024-11-15 7/350 2024-11-16 15:16 by zyqchem
[论文投稿] 期刊选择 +3 上善若水 cc 2024-11-15 3/150 2024-11-16 14:23 by lx7991
[基金申请] 博后资助名单出来了 +14 Shxjjxjkx 2024-11-14 16/800 2024-11-16 14:16 by icm639
[基金申请] 求助!请问海外博后依托内地单位申请青基的优劣? 80+3 2280999712 2024-11-15 10/500 2024-11-16 13:41 by dxcharlary
[教师之家] 北大教授何怀宏曾如此描述他的同行 +13 zju2000 2024-11-09 13/650 2024-11-16 07:45 by 080520dxf
[考博] 中南大学 粉末冶金国家重点实验室 陈超教授课题组拟招收 1~2位博士研究生通知 +7 中南大学-金属材 2024-11-14 18/900 2024-11-15 20:22 by 中南大学-金属材
[论文投稿] angew三个小修,返修过去已经20多天了没动静,有朋友遇到这种情况吗? +5 迟迟未到场 2024-11-14 5/250 2024-11-15 20:16 by 秦时明月zy
[考博] 随缘读博 一篇中科院一区Top 一篇中科院二区Top 两篇专利 +6 Ricoch4t 2024-11-13 15/750 2024-11-15 19:24 by 青青之洲
[基金申请] 去年七月底入站的还能申请下一批吗? +4 brightwo 2024-11-14 4/200 2024-11-15 14:18 by gazi1111
[基金申请] 广东省自然科学基金-面上项目消息有了么? +4 pachang 2024-11-14 6/300 2024-11-15 09:39 by zhoulei7170
[论文投稿] 投稿系统中的通讯作者和文章中的通讯作者不一样,文章目前被录用了? +4 babybabygo 2024-11-12 5/250 2024-11-14 19:13 by 走了002
[基金申请] 第76批博士后面上大概什么时间公示 +6 探际者 2024-11-11 7/350 2024-11-14 10:06 by Foxicut88
[论文投稿] 求JACS和ACIE的最新文章模板 10+4 Jane060390 2024-11-10 4/200 2024-11-13 09:13 by 北京莱茵润色
[基金申请] 浙江省青基怎么看A还是B? +8 ToallGoof 2024-11-11 14/700 2024-11-13 09:11 by Praybest
[硕博家园] 如何看清华北大硕博的毕业论文 +6 2025lucky 2024-11-10 6/300 2024-11-12 22:46 by 楚扬长流
[论文投稿] 投稿求助 40+3 liukun11 2024-11-12 4/200 2024-11-12 19:13 by liukun11
信息提示
请填处理意见