24小时热门版块排行榜    

查看: 2273  |  回复: 4

jinling158

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】相对定量可以不做标准曲线吗 已有3人参与

本人想做real time PCR, 做测试菌株和参照菌株之间A基因的表达差异,看了很多资料之后,觉得没有必要做标准曲线,原因如下:
目前主要用两种方法进行相对定量,其中之一是2-△△Ct法,该法前提是目的基因和参照基因有相同的扩增效率且接近100%;我认为用这种方法需要做标准曲线来看一下目的基因和参照基因的扩增效率是否相同。
另外一种方法是Pfaffl法,这种方法应用的前提是单个基因(目的基因和参照基因)在试验样本和标准样本中有相同的扩增效率,但不要求目的基因和参照基因有相同的扩增效率。但是用这种方法要知道目的基因和参照基因的扩增效率,请问一下做过的同学,如果不做标准曲线的话怎么知道目的基因和参照基因的扩增效率呢?另外,怎么确定单个基因在不同样本之间具有相同的扩增效率呢?

希望做过的童鞋发表一下您的高见,谢谢!

[ Last edited by jinling158 on 2010-7-2 at 17:37 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kikie

木虫 (正式写手)

★ ★
1949stone(金币+2):谢谢交流 2010-06-29 21:04:33
jinling158(金币+1): 2010-06-30 11:22:17
jinling158(金币+1): 2010-07-02 17:38:02
所以要做,呵呵。
用2-△△Ct分析,先做标准曲线,看该引物在样品中扩增效率是否一致,否则需要调整。
性痴则志凝,故书痴者文必工,艺痴者技必良;世之落拓无成者,皆自谓不痴者也
2楼2010-06-29 20:50:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jinling158

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by kikie at 2010-06-29 20:50:24:
所以要做,呵呵。
用2-△△Ct分析,先做标准曲线,看该引物在样品中扩增效率是否一致,否则需要调整。

我知道用2-△△Ct分析要做标准曲线,我的意思是说Pfall方法用不用做?
3楼2010-06-30 11:23:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

weiyang1386

金虫 (小有名气)

jinling158(金币+1): 2010-07-08 11:04:39
jinling158(金币+1):对的 2010-07-08 11:05:22
jinling158(金币+1): 2010-07-08 11:05:39
这样一般如果不用一楼的做法,貌似还是要用不同浓度的样品做管家基因和样品分别作曲线,即双标发,然后以样品对管家基因的比值来相对定量。
如果说的不对见谅啊!
4楼2010-07-07 18:26:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jinling158

铜虫 (小有名气)

楼上的说得对,我现在已经有思路了,谢谢参与!
5楼2010-07-08 11:06:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jinling158 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +16 基诺咪客 2026-08-17 20/1000 2026-08-20 12:44 by 201120518022
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +16 Ldrop2023 2026-08-13 20/1000 2026-08-20 11:07 by xskun
[基金申请] 言之凿凿,8月21号(明天)放榜 +12 医学老男孩 2026-08-20 14/700 2026-08-20 10:53 by ran2233
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +21 yaoyewhu2008 2026-08-20 21/1050 2026-08-20 10:37 by Vivilian
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +55 医学老男孩 2026-08-13 125/6250 2026-08-20 09:02 by 医学老男孩
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +14 kkkl_v 2026-08-19 15/750 2026-08-20 08:21 by sunzitan
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +4 yuleib84 2026-08-19 5/250 2026-08-19 19:52 by hhs666
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +10 wangze12014 2026-08-14 12/600 2026-08-19 16:56 by 苦难博士
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 什么时候开奖? +6 CrisMessi 2026-08-18 6/300 2026-08-19 08:06 by Equinoxhua
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
信息提示
请填处理意见