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xifengjin

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】求助:怎么求螺旋的"helix twist angle"? 已有4人参与

最近工作需要分析一个双螺旋结构,其中涉及到螺旋的扭转角,查到它的定义是:
  定义: 碱基对中c1 c1 连线与相邻的另一碱基对中的对应连线, 投影到与螺旋轴垂直的平面上的夹角。对B—DNA,纤维衍射的结果约为36°。
  可是不会求,哪位大侠可以指导下,或者有这方面的资料
  感激不尽~
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yunruirui

荣誉版主 (著名写手)

云朵爸


xifengjin(金币+1):谢谢参与
你可以讲你的图形上传上来,让大家看看,应该对解析这个问题有帮助的。
2楼2010-06-27 13:51:17
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xifengjin

金虫 (正式写手)

yunruirui:已经看了,不太清楚,还在研究 2010-06-27 14:40:01
http://d.namipan.com/d/6c7596c08 ... 19fb79c304711220000
文献的CIF文件
http://d.namipan.com/d/6893672f5 ... a7a61f8897fb6500c00
相关文献
   文献中用黄色标注了作者量的“螺旋扭转角”,两个NI中心间为75度,三个之间为149度;
我用HG量,怎么也得不到这样的数据,请大家帮忙看一看
3楼2010-06-27 14:31:19
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xifengjin

金虫 (正式写手)

4楼2010-06-27 14:35:41
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yunruirui

荣誉版主 (著名写手)

云朵爸

我看了下,可能是人家解析的时候用命令计算了扭转角。只是推测,期待高手出现
5楼2010-06-27 14:39:07
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bsnow

木虫 (小有名气)


xifengjin(金币+1):谢谢参与
我也不懂 支持一下!!!
6楼2010-06-27 21:49:08
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xifengjin

金虫 (正式写手)

yunruirui:谢谢提供 2010-06-28 10:04:04
终于被我发现怎么算的啦

也好简单的-。-!
如下:



在上图中,找到一条螺旋线上合适的原子,跟中心原子一起,设置成球棍模型,旋转成投影图模式,然后保存成图片。用个屏幕测角工具(MB-Ruler比较好用),进行角度测量,就是该螺旋的螺旋扭转角了……

希望大家有用
------------------------------
请版主关闭求助,谢谢
7楼2010-06-28 01:22:42
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xifengjin(金币+1):谢谢参与
8楼2010-06-28 07:37:27
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