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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 动植物 » 综合其他 » 【求助/交流】mRNA和 exon是什么关系
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ziyunpy

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】mRNA和 exon是什么关系 已有3人参与

mRNA和 exon是什么关系
exon1+exon2+exon3+......=mRNA吗？
还是exon1+exon2+exon3+......=CDS区？
有点糊涂了，请教大家，谢谢！
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努力不等以成功
1楼 2010-06-22 16:34:18
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ziyunpy

新虫 (小有名气)

这个序列什么意思

AUTHORS   Koltes,J.E., Mishra,B.P., Kumar,D., Kataria,R.S., Totir,L.R.,
            Fernando,R.L., Cobbold,R., Steffen,D., Coppieters,W., Georges,M.
            and Reecy,J.M.
  TITLE     A nonsense mutation in cGMP-dependent type II protein kinase
            (PRKG2) causes dwarfism in American Angus cattle
  JOURNAL   Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106 (46), 19250-19255 (2009)
   PUBMED   19887637
REFERENCE   2  (bases 1 to 2450)
  AUTHORS   Koltes,J.E., Mishra,B.P., Kumar,D., Kataria,R.S., Totir,L.R.,
            Fernando,R.L., Cobbold,R., Steffen,D., Coppieters,W., Georges,M.
            and Reecy,J.M.
  TITLE     Direct Submission
  JOURNAL   Submitted (16-JUL-2009) Department of Animal Science, Iowa State
            University, 2255 Kildee Hall, Ames, IA 50011-3150, USA
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..2450
                     /organism="Bos taurus"
                     /mol_type="genomic DNA"
                     /db_xref="taxon:9913"
                     /chromosome="6"
                     /note="breed: Angus"
     gene            1..2450
                     /gene="FGF5"
     misc_feature    1..113
                     /gene="FGF5"
                     /note="contains promoter region and 5' UTR"
     mRNA            <114..>478
                     /gene="FGF5"
                     /product="fibroblast growth factor 5"
     CDS             114..>478
                     /gene="FGF5"
                     /note="coding region disrupted by a sequencing gap"
                     /codon_start=1
                     /product="fibroblast growth factor 5"
                     /protein_id="ADE42981.1"
                     /db_xref="GI:293337385"
                     /translation="MSLSFLLLLFLSHLILSAWAQGEKRLAPKGQPGPAATERNPGGA
                     SSRRSSSSTATSSSSPASSSSAASRGGPGSSLEQSSFQWSPSGRRTGSLYCRVGIGFH
                     LQIYPDGKVNGSHEANMLS"
     gap             624..723
                     /estimated_length=unknown
     mRNA            <731..>1078
                     /gene="FGF5"
                     /product="fibroblast growth factor 5"
     CDS             <731..1078
                     /gene="FGF5"
                     /note="coding region disrupted by a sequencing gap"
                     /codon_start=1
                     /product="fibroblast growth factor 5"
                     /protein_id="ADE42982.1"
                     /db_xref="GI:293337386"
                     /translation="AKFTDDCKFRERFQENSYNTYASAIHRTEKTGREWYVALNKRGK
                     AKRGCSPRVKPQHVSTHFLPRFKQLEQPELSFTVTVPEKKKPPNPVKPKVPLSAPRRS
                     PNTVKYRLKFRFG"
     gap             1345..1444
                     /estimated_length=unknown
ORIGIN      
        1 atgtccaccc ggtgcggcga ggggggcagc gccagaggca cgcagccgcg caggggctac
       61 gaagcccaga accaaccctg caagatgcac ttaggacccc cgcggctgga agcatgagct
      121 tgtccttcct cctcctcctc ttcctcagcc acctgatcct cagcgcctgg gctcaagggg
      181 agaagcgcct cgcacccaaa gggcagcccg gacctgctgc caccgagagg aacccgggag
      241 gcgccagcag ccgccggagc agcagtagca ccgcgacttc ctcttcttcc cctgcctcct
      301 cctcctccgc ggcttctcgg ggcggcccag gaagcagctt ggagcagagc agcttccagt
      361 ggagcccctc ggggcgccgg accggcagcc tctactgcag agtgggcatc ggtttccatc
      421 tgcagatcta cccggatggc aaagtcaacg gctcccacga agccaatatg ttaagtaagt
      481 tgcttgctst cctccaaaac ctgtcttgag cgggtggcgg gagcatcgag agggaccgcc
      541 ggttattccc caggctgtaa gcgcaccttc cggagcctgg gccactggga tcccagccgg
      601 ccctcgaaac agccgggttg ggt                                       
          [gap 100 bp]    Expand Ns
      724    cctctag gccaaattta cagatgactg caagttcagg gagcgatttc aagaaaacag
      781 ctataatacc tatgcctctg cgatacacag aactgaaaag acggggcggg agtggtacgt
      841 ggccctgaac aagaggggga aggctaaacg gggctgtagc ccccgggtta aacctcagca
      901 cgtctctacc cactttctgc caagattcaa gcaattggag cagccggaac tttctttcac
      961 agttactgtt cccgaaaaga aaaagccacc taatcctgtc aagccaaagg ttcccctttc
     1021 cgcacctcgg agaagtccta acaccgtgaa atacagactc aagtttcgct ttggttaaga
     1081 cttactttgg ttttgtgaga aaccatgrag tctcctcagg agtttctgca gctgtcctca
     1141 gtgctctgaa gacaacttct tggacacagc ttcagctata tactacactg tattgaagtc
     1201 aggtcatttg tttcagcttg actgaaacaa aaatgttttc tgatagtaac tgaactggaa
     1261 ttctttgtac caatataggg agttcacgac gacataaagc cttttgcttt atgcttggtg
     1321 catacaggga ttcttttttg gaaa                                      
          [gap 100 bp]    Expand Ns
     1445     tttttc tgacttttac agatcaacct gaagaaaaca tacatgatac atttttattt
     1501 ttggtttcca aagaatattt tgatggagat aaaagtattt tattagattt ttttttaaag
     1561 tacctctgca ttgagcatat tttcttactt ttattatttc taattgataa gatatgaaac
     1621 aaccatttta atgcagttta tgaattataa atatgtttat agaccatttt taacatgtgg
     1681 atttcttttt cattgttctc aktcattgca cttttaattt ttattatgat tgtttttcta
     1741 ccatacctca gatcatgtaa gtttaatttt acatcttaaa atgtttaaat tctcttcaac
     1801 agcactaaag sctcagcttg tgtttgtgtg tgtgtgtgag tgtgtgtaaa ttcatgattt
     1861 tatatatgga atcctgtctc tgtggtggct gggctataat gggttagaag taaggagaaa
     1921 acgtaaggaa tttttggtgg aattaaaagt tgaggcaagg aaaagaatta gaggttcaag
     1981 tgcactgatt ttgcagtgtt tattgatagc taattctacy ttgccttcac ttcccatttt
     2041 atctaccccc tgccctcatt ctttaaagct ggagaaatac attttattct gtccatcaag
     2101 catagactat gaaaccagag tgcttaaaat acctcttcta tgaccttctg ctatctccac
     2161 tgtatagatc cacagggagc aacccattta gtggaaaaac ayggagaacc gaaggagatg
     2221 aatcatgtaa cagttatcca tgtcaagtcc cattatctaa aatattatta ctcaaacact
     2281 ctttgagttt cctatcctaa aggtaaacac ctcagtgaat agatctgccc ttttataagg
     2341 aaaatttcta tgtatatttt taaatagttg gctatgtgac atgggaaact taatctgatg
     2401 agytgaaaat ggcacttaaa tgtcaaccca aatactgaat gtttggtata
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努力不等以成功
2楼2010-06-22 16:51:38
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雪山飞狐7233

铁杆木虫 (著名写手)

铁杆小虫
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
amisking(金币+1):good！ 2010-06-22 17:53:04
mRNA包括了内含子和外显子。通过RNA的拼接和剪辑去掉内含子
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梦在路就在！
3楼2010-06-22 17:05:45
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ben1147

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
mRNA=5’UTR+exon1+。。。。+exonN+3‘UTR+poly(A)
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-06-22 18:18:15
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