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【小卒个人文集】你的分子,如果让我来搭建初始构型,我会怎么办
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yjcmwgk
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[交流]
【小卒个人文集】你的分子,如果让我来搭建初始构型,我会怎么办
已有23人参与
看了虫友il708写的帖子,
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2116450
,我久久不能平静。这样的虫友实在是太认真了!!大家要向他学习啊。他的扭曲稠合环的获得过程又巧妙又精细……嗯……怎么说呢……应该说是太精细了。通过X原子的定位,细心调整构型,最终得到C2V构型的扭曲稠合环,真是太努力了。大家鼓掌……撒花……
这里我提供一种扭曲稠合环的画法,非常简单,也不用细心调整位置,粗粗拉拉的,随便一画,也能得到C2V结构的扭曲稠合环。还请大家斧正
第一步:先从GV中调出并三苯(GV中有并三苯的模板)
第二步:再从GV中调出苯环的模板,用单键连接上去,然后删掉两个氢,并修改四个键的键级。觉得自己画上去的苯环位置不好?没关系的,只要规定键级为单键即可。
第三步:用“小扫把”扫一下,就得到如下结构(小扫把就是GV面板上的clean按钮,其实是经过高斯公司改良之后的MM2)
第四步:删掉一个苯环,立刻得到C2v结构的扭曲稠合环
呵呵,是不是很爽?
[
Last edited by yjcmwgk on 2010-10-12 at 08:55
]
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