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luckone2013

银虫 (小有名气)

[交流] 计算阴离子分子的垂直分裂能，怎么保持分子构型不变？

阴离子分子的构型已经优化好了，需要计算阴离子到分子的垂直分裂能。另存了gjf，电荷及多重度知道怎么修改成中性分子的，但是，基组的命令行需要加什么才能让几何构型在优化过程中保持和阴离子相同的构型？
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1楼 2013-06-01 17:44:10
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liuyu1989

木虫 (正式写手)
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luckone2013: 金币+3 2013-06-04 12:53:39
把电荷改为0就是中性分子了，然后对中性分子进行优化，多重度会自动生成吧，优化过程中构型应该变化不大吧，分别对阴离子和中性分子计算单电能就可以了。
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2楼2013-06-04 11:26:17
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luckone2013

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuyu1989 at 2013-06-04 11:26:17
把电荷改为0就是中性分子了，然后对中性分子进行优化，多重度会自动生成吧，优化过程中构型应该变化不大吧，分别对阴离子和中性分子计算单电能就可以了。

喔，这样啊，大哥有计算单点能的模板吗
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3楼2013-06-04 12:52:41
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liuyu1989

木虫 (正式写手)
★ ★
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luckone2013: 金币+1 2013-06-04 20:38:47
计算单点能很简单的，你结构优化完之后，在计算能量就是单点能；分别计算阴离子和中性分子的单点能，两者的差值应该就是你要求的垂直分裂能。还不懂就在问吧
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4楼2013-06-04 14:47:36
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hairan

木虫 (著名写手)
★ ★
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luckone2013: 金币+1 2013-06-04 21:10:49
应该叫垂直电离能吧，如果说的是一个东西的话，只需要优化阴离子就行了（需要opt关键词）
在优化好的阴离子结构基础上，保持结构不变，计算分子电荷变为0之后分子的能量就好。（不加Opt关键词）

如果还要优化的中性分子的结构的话，就不叫垂直电离能了，那个叫绝热电离能。
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5楼2013-06-04 15:13:41
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luckone2013

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by hairan at 2013-06-04 15:13:41
应该叫垂直电离能吧，如果说的是一个东西的话，只需要优化阴离子就行了（需要opt关键词）
在优化好的阴离子结构基础上，保持结构不变，计算分子电荷变为0之后分子的能量就好。（不加Opt关键词）

如果还要优化的 ...

垂直电离能和垂直分裂能两个说法意思一样，大哥说的意思我明白。
但是以前有人在帖子上跟我说过需要将分子结构设置成nosymm，我在试了他说的方法，AlF4-阴离子电荷设置成0，模拟了以后居然出现了两个虚频。。。我感觉那个nosymm只是关于分子的对称性，而与几何结构无关的。
所用基组如下，请指教
%chk=AlF4-bh.chk
#p ubhandhlyp/6-31+g(d,p)
scf(maxcyc=500) freq(noraman) nosymm

Title Card Required

0 2
Al                -0.00000300   -0.00007600   -0.00011600
F                  1.37256500   -0.99115600   -0.04792800
F                 -1.39319600   -0.96279900   -0.02578400
F                 -0.00021800    1.02935400   -1.34403600
F                  0.02085400    0.92471000    1.41791500
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6楼2013-06-04 21:08:56
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luckone2013

银虫 (小有名气)
???????:
2?: Originally posted by liuyu1989 at 2013-06-04 11:26:17
??????0????????????????????????????????????????????????????????й??????仯??????????????????????????????????????

是??是应该把opt去掉啊，我是这样???的
%chk=AlF4-bh.chk
#p ubhandhlyp/6-31+g(d,p)
scf(maxcyc=500) freq(noraman) nosymm

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0 2
Al                -0.00000300   -0.00007600   -0.00011600
F                  1.37256500   -0.99115600   -0.04792800
F                 -1.39319600   -0.96279900   -0.02578400
F                 -0.00021800    1.02935400   -1.34403600
F                  0.02085400    0.92471000    1.41791500
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7楼2013-06-04 21:31:52
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hairan

木虫 (著名写手)
★
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引用回帖:
6楼: Originally posted by luckone2013 at 2013-06-04 21:08:56
垂直电离能和垂直分裂能两个说法意思一样，大哥说的意思我明白。
但是以前有人在帖子上跟我说过需要将分子结构设置成nosymm，我在试了他说的方法，AlF4-阴离子电荷设置成0，模拟了以后居然出现了两个虚频。。。我 ...

你没有优化中性分子, 阴离子的平衡结构肯定不是中性分子的平衡结构, 因此有虚频一点也不奇怪
奇怪的是你为什么要算频率, 要跟实验结果对比吗?
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8楼2013-06-05 07:55:50
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