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匿名

用户注销 (正式写手)

外星球文坛精英
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1楼 2010-06-15 10:05:29
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2008从容

金虫 (小有名气)
同问，请大侠指点
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2楼2010-06-15 10:44:22
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★
gjin101(金币+1):%nprocshared=4 %nproclinda=单机 %mem=4000MB，该怎样呢 2010-06-15 15:14:41
gjin101(金币+1):MP2(6-31g(d,p)),过渡金属用赝势，电荷+1，多重2， 2010-06-15 15:18:10
heyo_123(金币+1):是牛人，非神！ 2010-06-16 17:33:08
体系、方法、基组、基函数的数量、计算资源（%nprocshared=?  %nproclinda=?  %mem=?  maxdisk=?），一个都没说……除非是神，没人能回答

有人说世界上本没有神。凡人一旦做到了凡人不能做到的事情，那么他就成了神。However，这个版上都是凡人……

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-6-15 at 12:28 ]
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3楼2010-06-15 12:27:15
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
★
heyo_123(金币+1): 2010-06-17 21:24:50
gjin101(金币+1):那么同样基组，DFT优化会快很多吗 2010-06-17 23:48:06
这么大小的体系，mp2如果做优化，2-3天再正常不过了，如果算频率，一个星期也未必。如果单点算，2-3天那就有问题了。
用DFT当然要快很多了。优化一天一个差不多没问题——当然，你的初始结构也很重要，但相同情况下，DFT比mp2快几倍是不成问题的。所以一般科研中，你这样的体系，都是DFT优化的，如果为了得到更精确的能量数据，可以在DFT优化结构的基础上，做一个单点算就可以了，发3.0左右的文章在数据上是可以过关的了。

[ Last edited by zhangmt on 2010-6-18 at 01:19 ]
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一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
4楼2010-06-17 20:54:55
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wang0912302

铁虫 (正式写手)

拜读大文了，，，

★
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引用回帖:
Originally posted by zhangmt at 2010-06-17 20:54:55:
这么大小的体系，mp2如果做优化，2-3天再正常不过了，如果算频率，一个星期也未必。如果单点算，2-3天那就有问题了。
用DFT当然要快很多了。优化一天一个差不多没问题——当然，你的初始结构也很重要，但相同情况 ...

拜读大文了，，，小弟研一，目标很简单就是3.0的ＪＣＰ，，，恳请大虾帮助和指点，我用的是Ｂ３ＬＹＰ计算的ＡｌＦｅ体系，初始构型先是在Ｄｍｏｌ３里面优化的，那么我的问题就是对于给定模型我是只进行一次（Ｃｏａｒｓｅ）级别的Ｄｙｎａｍｉｃ后Ｇｅｏｍｅｔｒｙ　Ｏｐｔｉｏｎｓ呢？还是在这个Ｄｙｎａｍｉｃ基础之上再进行两次（Ｍｅｄｉｕｍ）和（Ｆｉｎｅ）级别的Ｄｙｎａｍｉｃ呢？确实Ｄｙｎａｍｉｃ很耗时，算起来很慢。但是我觉得这样会接近构型的真实模型。老板的意思就是一次（Ｃｏａｒｓｅ）的Ｄｙｎａｍｉｃ之后分别三次的（Ｃｏａｒｓｅ）（Ｍｅｄｉｕｍ）（Ｆｉｎｅ）级别的Ｇｅｏｍｅｔｒｙ　Ｏｐｔｉｏｎｓ就可以了，这样子很快，但是我感觉不是很准确，恳请大虾指点，，，
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5楼2010-06-18 09:23:44
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
★
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抱歉，没用过DMol，不敢说。。你没说你算的是气相分子反应，还是表面材料，我不敢乱说。是周期性体系，还是仅仅一个分子，不敢瞎猜。就只模拟一个构型，发不了JCP，至少要有机理，并与实验数据互相验证吧。只用过gaussian，而你说的信息我都没接触过，不敢猜测。。飘过。。
请其他专家援手。
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6楼2010-06-18 09:31:14
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coolrainbow

木虫 (著名写手)

未来国家冻凉
★
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我研究生三年的目标定为0.937的高等化学学报
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技术博客：http://hi.baidu.com/coolrainbow/blog
7楼2010-06-18 09:53:56
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
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那是老板对你最大的支持啊。
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8楼2010-06-18 11:52:54
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匿名

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9楼2010-06-18 14:04:10
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

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★
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行啦，cool你又在这里忽悠人。你发高等化学学报？谁信啊……你的计算任务里的下脚料都够JPC、JCP了

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-6-18 at 14:06 ]
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10楼2010-06-18 14:05:04
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