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dhmdddd

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】关于基因敲除已有5人参与

最近在做大肠基因敲除,转化的是PCR产物,是DNA片段,2000Kb多点,转化后,平板上有菌落长出来,接摇瓶转化子也长,同样的抗生素浓度下转化前的菌株不长,这可以说明转化子表现抗性吧?但是验证PCR时,P出来的条带总是在一条线上,也就是说没有重组上,感觉很奇怪,不知道各位有没有遇到这种情况,这到底是什么原因,转化进去片段应该不会表达的吧?不知道我有没有把问题说清楚,请高手指教!!先谢过了!!
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木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 临风7071 at 2010-06-10 10:05:44:
做酶切验证,那是最准确的方法。另外,你PCR时应该做阳性对照,以验证是否是PCR的问题

PCR我做了一个未转化菌株的对照,P出来的条带和转化子P出的条带在在一条带上,我点样时加了一个Marker,结果是全部都没有到2000K,这个应该可以说明PCR没有问题的吧?
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4楼2010-06-10 12:19:46
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木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 鹏飞九万里 at 2010-06-10 12:25:31:
你的pcr片段大小是不是和你要敲除的基因片段大小差不多?

不是的,,我是拿菌的全基因P的,这肯定不一样大的吧……
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6楼2010-06-10 13:06:30
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木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 鹏飞九万里 at 2010-10-19 10:30:45:
lz问题解决了没?我也遇到这样的问题了。。。

没有解决,始终不知道是为什么,我在别的地方看到基因片段转进去基本上是不会表达的,还是疑惑中……
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10楼2010-10-20 08:36:54
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木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by kaoyan1230 at 2010-10-19 16:06:27:
具体的比对一下你的基因片段大小和PCR产物的大小是否差不多吧,有的时候大小差别很少的。
也可以在你PCR产物的中间设计一个引物,这样做PCR的话,只有阳性的菌落才能P出来。

我插入的片段大概有一千多,加上来的话就应该有三千左右吧,差了一千应该很容易就看的出来吧……设计中间引物也设计了,就是表现出来抗性的菌用中间引物P的时候是乱的,这说明是没有重组上的……很是不理解……
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11楼2010-10-20 08:46:29
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木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 寂寞之巅 at 2010-10-20 09:32:28:
有假阳性克隆 有可能你的PCR产物里面混有质粒,不知道你是不是用质粒做模板来P基因的

我敲除基因最后目的是让抗性基因重组到大肠杆菌上面,最后验证的时候都是那菌落做PCR的……
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13楼2010-10-20 16:08:17
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dhmdddd

木虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
: Originally posted by 寂寞之巅 at 2010-10-24 10:29:14:
DpnI 是一种酶,作用于甲基化位点  去除质粒模板

谢谢~
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21楼2011-12-24 19:09:53
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