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新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】请教大家关于dna提取的问题 已有12人参与

我提的是植物基因组dna,用过ctab法和试剂盒,但效果都不理想,具体问题是
提取出的dna用1倍TE溶解后,会出现絮状沉淀,可以确定不是dna,因为放置两三天后还是有,dna经紫外分光光度计检测正常,但琼脂糖检测结果很不好,有拖尾。

我想请教大家这是什么原因,是dna降解还是有糖酚类杂质?如果是杂质该怎么去除?(我用的ctab法抽提两遍)

附上dna琼脂糖图片

都是用试剂盒提的





[ Last edited by 换换 on 2010-6-8 at 17:43 ]
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新虫 (初入文坛)

自己顶一下吧
2楼2010-06-08 16:12:11
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新虫 (初入文坛)

★ ★
reasonspare(金币+2):谢谢分享。 2010-06-09 06:24:17
引用回帖:
Originally posted by dfl204 at 2010-06-08 16:20:25:
1.从带型上来看,你所提取的DNA都有降解的嫌疑;
不知道你的上样量是多少,最好再少取一些稀释之后在点样看看,如果只有一条主带那就是没有降解的(蚕豆那个样品应该是不会有问题的);
2.下面一块胶的样品不 ...

先谢谢大虾~~

1 有降解的话,那能做AFLP吗?比如第一张图,我操作还算严格啊,样品放-80度,加缓冲液前用液氮处理,从脱离冰箱到加入液氮时间很短,不超过2分钟。
但是有可能样品在送来实验室之前冻融过,不过也就一二次。

2我上样量4μl,dna2μl,蚕豆那个事对照,我做的不是蚕豆

3都是用试剂盒提的,跟用ctab法效果差不多

[ Last edited by 换换 on 2010-6-8 at 17:35 ]

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9楼2010-06-08 17:30:06
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新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by 知秋 at 2010-06-08 17:07:02:
看不到图,其实没关系的,看你后面要做什么了,很多实验对DNA质量要求不是很高的阿

呵呵,我做AFLP,貌似要求比较高。。。。。。

但是我同学用我的降解的dna做出来了,而且条带也比较清晰

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10楼2010-06-08 17:33:14
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新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by ben1147 at 2010-06-08 17:34:20:


提DNA怕的不是化冻的时间,而是提的过程中抽吸、震荡等导致的机械剪切

哦,但我同学一样用的是试剂盒,操作都差不多,提出来的几乎一点没降解啊,
不同的是材料,他的是新鲜材料,就是一长出来马上提取幼叶dna,我的材料是从别处采集的,也是别处送过来的
12楼2010-06-08 17:40:08
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新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by lyg7720349 at 2010-06-09 00:56:25:
感觉DNA受蛋白污染了,我以前试剂盒提的时候也是到乙醇沉淀哪一步总会出现白色絮状团状物,也溶不掉,导致DNA得率非常低,没办法了用常规方法提了。

是材料蛋白含量太高还是受蛋白污染了,我觉得应该是材料本身蛋白含量高吧

不知道白色沉淀会不会影响dna沉淀,反正我的得率也很低,你又用什么方法提的?效果怎么样?
14楼2010-06-09 08:41:15
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