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换换

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】请教大家关于dna提取的问题 已有12人参与

我提的是植物基因组dna,用过ctab法和试剂盒,但效果都不理想,具体问题是
提取出的dna用1倍TE溶解后,会出现絮状沉淀,可以确定不是dna,因为放置两三天后还是有,dna经紫外分光光度计检测正常,但琼脂糖检测结果很不好,有拖尾。

我想请教大家这是什么原因,是dna降解还是有糖酚类杂质?如果是杂质该怎么去除?(我用的ctab法抽提两遍)

附上dna琼脂糖图片

都是用试剂盒提的





[ Last edited by 换换 on 2010-6-8 at 17:43 ]
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新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by lyg7720349 at 2010-06-09 00:56:25:
感觉DNA受蛋白污染了,我以前试剂盒提的时候也是到乙醇沉淀哪一步总会出现白色絮状团状物,也溶不掉,导致DNA得率非常低,没办法了用常规方法提了。

是材料蛋白含量太高还是受蛋白污染了,我觉得应该是材料本身蛋白含量高吧

不知道白色沉淀会不会影响dna沉淀,反正我的得率也很低,你又用什么方法提的?效果怎么样?
14楼2010-06-09 08:41:15
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dfl204

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
reasonspare(金币+2):谢谢分享。 2010-06-09 06:22:57
1.从带型上来看,你所提取的DNA都有降解的嫌疑;
不知道你的上样量是多少,最好再少取一些稀释之后在点样看看,如果只有一条主带那就是没有降解的(蚕豆那个样品应该是不会有问题的);
2.下面一块胶的样品不知道是否去RNA了,如果没有那就应该是降解了。
3楼2010-06-08 16:20:25
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zouting

金虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
reasonspare(金币+1):谢谢分享。 2010-06-09 06:23:19
我也用CTAB法提的,提的蚕豆根的,为的是说明凋亡,但是没跑出梯状条带,可是也没有拖尾什么的。当时做的时候是用PCI一次,CI总共三次
4楼2010-06-08 16:21:57
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crydevil

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
怀疑是操作剧烈 DNA断了,而且杂质也多了
6楼2010-06-08 16:33:13
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