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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 【求助/交流】系统进化的分析
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lylovess

禁虫 (初入文坛)
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1楼 2010-06-02 13:20:57
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1949stone

荣誉版主 (知名作家)

海纳百川
★ ★ ★
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lstt09nk(金币+2):石头~~ 2010-06-02 17:48:36
在ncbi撒谎能够找到标准序列
对比一下
一般情况下 某段基因的全序列 是要切掉引物的
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海纳百川止于至善
2楼2010-06-02 14:52:52
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dianaofyezi

金虫 (正式写手)
一般不加入引物部分进行比对。如果ORF是完整的可以直接进行比较。
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52187644
3楼2010-06-02 20:52:58
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09021122

木虫 (正式写手)
★ ★
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scelab(金币+1):欢迎多来交流！:tiger06: 2010-06-02 22:35:59
我现在也做的是系统进化方面的，实验的样品比你的多多了，
不过只扩增两个细胞器基因，我们再进行序列比对时必须把引物序列除掉，
保证所扩序列的准确性，并且在做构树分析时，序列必须一样长，两端不能有gap。
很复杂啊***
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雄关漫道真如铁，而今迈步从头越
4楼2010-06-02 21:35:22
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lylovess

禁虫 (初入文坛)
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5楼2010-06-02 22:34:26
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dianaofyezi

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
慢工出细活。尽可能多的挑选有代表性的序列进行比较，查阅多的相关文献挑选出代表株。如果你的周围有生物信息学老师可以向他们请教下，可以提高工作效率。
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52187644
6楼2010-06-03 09:57:04
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iorimouse

新虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我也是做系统进化的，种类太多了，以后分析起来有的麻烦了。。。
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7楼2010-06-03 10:29:04
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xiaofeiyu8075

铜虫 (小有名气)
★
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lz，你做过ribotype吗？
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8楼2010-06-10 10:19:05
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zsxnd

铁杆木虫 (著名写手)
★
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直接fenxi ORF
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9楼2010-06-10 17:14:57
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lylovess

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10楼2010-06-12 16:52:05
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