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【求助/交流】已知基因序列如何克隆获得
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xiaoru2010
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[交流]
【求助/交流】已知基因序列如何克隆获得
已有8人参与
已知某材料的某基因序列,含3'端尾巴。
问题1。如何判断该序列是否含有5'端帽子?
问题2.如果含有,怎么克隆获得该基因?
老板说不做RACE也可以扩出来,有没有高手支招?多谢啦!!!!
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1楼
2010-05-13 17:54:46
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引用回帖:
Originally posted by
yujiaping1
at 2010-05-13 22:53:44:
建个文库,就能得到想要的基因吗?未必吧,范围太大,花钱太多,目的基因却不能确定获得,而且获得的序列也不是全长,想得到全长,最后还是要走到RACE之类的实验上来
现在建一个cDNA全长文库公司做的话是3万左右吧。
我觉得文库的优点是你可以通过后续的筛库(杂交或同源克隆等)的策略克隆得到你想要的一类基因(可能许多个同源基因),至于是否是全长呢,一是看你的基因大小;另外就是文库的质量了。不行的话就拼接相关序列吧,回到了类似楼主的问题了。
另外,有了文库,也可以做其他的基因,大家都能用。
个人观点,欢迎讨论。
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7楼
2010-05-13 23:59:01
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一头一尾设引物直接扩~
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2楼
2010-05-13 19:09:50
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yujiaping1
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lstt09nk(金币+1):欢迎多多交流~~ 2010-05-13 22:17:42
问题1 查一下阅读框,看看包不包含ATG,是否是完整的阅读框
也可以直接blast比对,也许就有同源基因的序列,如果和同源基因一样长,或者更长,就肯定到头了
问题2 如果具有完整的阅读框,就设计包含阅读框的引物进行扩增,可拿到完整的阅读框
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3楼
2010-05-13 20:17:07
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):给个红包,谢谢回帖交流
有cDNA全长文库的话就好了,现在大家怎么都喜欢做RACE呢,构建个文库不更好吗?效率高,一个实验室都可用。
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4楼
2010-05-13 22:08:50
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