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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】已知基因序列如何克隆获得
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xiaoru2010

[交流] 【求助/交流】已知基因序列如何克隆获得 已有8人参与

已知某材料的某基因序列，含3'端尾巴。
      问题1。如何判断该序列是否含有5'端帽子？
     问题2.如果含有，怎么克隆获得该基因？
      老板说不做RACE也可以扩出来，有没有高手支招？多谢啦！！！！
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1楼 2010-05-13 17:54:46
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yujiaping1

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+1):欢迎多多交流~~ 2010-05-13 22:17:42
问题1 查一下阅读框，看看包不包含ATG，是否是完整的阅读框
也可以直接blast比对，也许就有同源基因的序列，如果和同源基因一样长，或者更长，就肯定到头了
问题2 如果具有完整的阅读框，就设计包含阅读框的引物进行扩增，可拿到完整的阅读框
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3楼2010-05-13 20:17:07
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yujiaping1

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by changes at 2010-05-13 22:08:50:
有cDNA全长文库的话就好了，现在大家怎么都喜欢做RACE呢，构建个文库不更好吗？效率高，一个实验室都可用。

建个文库，就能得到想要的基因吗？未必吧，范围太大，花钱太多，目的基因却不能确定获得，而且获得的序列也不是全长，想得到全长，最后还是要走到RACE之类的实验上来
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5楼2010-05-13 22:53:44
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yujiaping1

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
用软件设计吧，尽量符合原则就行，引物设计就是个经验，能不能跑出来还得看运气了
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12楼2010-05-14 08:53:42
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