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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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letitgone

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】请问gaussian优化金属螯合小分子的一般步骤? 已有7人参与

各位大牛牛们好,我想要对一个螯合了Zn2+的小分子结构进行优化。
小分子与Zn2+之间是四配位键结合。
我查了以前的帖子,人家说用lanl2dz基组(#B3lyp/LANL2DZ)
但是我不知道Gaussian的一般步骤应该如何?是先固定Zn2+优化小分子呢?还是先固定小分子优化Zn2+呢?还是小分子上与Zn2+配位的4个重原子也要相应的固定以保持金属与小分子的相对位置不变呢?
谢谢大家的耐心解答
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fooo

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
aylayl08(金币+2):谢谢提示 2010-04-29 16:33
如果分子不太大,直接优化不就可以了吗?为什么要固定呢?另外配位键也好,共价键也好,计算过程是一样的,软件并不认得这些键,它们是人自己分析出来的。
引用回帖:
Originally posted by letitgone at 2010-04-27 10:15:33:
各位大牛牛们好,我想要对一个螯合了Zn2+的小分子结构进行优化。
小分子与Zn2+之间是四配位键结合。
我查了以前的帖子,人家说用lanl2dz基组(#B3lyp/LANL2DZ)
但是我不知道Gaussian的一般步骤应该如何?是先 ...

4楼2010-04-29 04:33:09
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cy2003

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我也想计算配位键,刚接触gaussian什么都不知道,同lz一起等高手来指导
2楼2010-04-28 19:09:36
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luxi_bg

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我也想计算配位键,高手快来支招啊
3楼2010-04-29 00:06:43
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jxzhao

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
aylayl08(金币+2):鼓励交流 2010-04-29 16:33
引用回帖:
Originally posted by letitgone at 2010-04-27 10:15:33:
各位大牛牛们好,我想要对一个螯合了Zn2+的小分子结构进行优化。
小分子与Zn2+之间是四配位键结合。
我查了以前的帖子,人家说用lanl2dz基组(#B3lyp/LANL2DZ)
但是我不知道Gaussian的一般步骤应该如何?是先 ...

我最近也在算!我认为直接优化就可以了,但是与你的初始结构有关系,而且与溶剂相也有很大关系,一般气相最容易!
5楼2010-04-29 10:59:18
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