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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 量化新手直通车 » 【求助】请问gaussian优化金属螯合小分子的一般步骤？
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letitgone

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】请问gaussian优化金属螯合小分子的一般步骤？ 已有7人参与

各位大牛牛们好，我想要对一个螯合了Zn2+的小分子结构进行优化。
小分子与Zn2+之间是四配位键结合。
我查了以前的帖子，人家说用lanl2dz基组（#B3lyp/LANL2DZ）
但是我不知道Gaussian的一般步骤应该如何？是先固定Zn2+优化小分子呢？还是先固定小分子优化Zn2+呢？还是小分子上与Zn2+配位的4个重原子也要相应的固定以保持金属与小分子的相对位置不变呢？
谢谢大家的耐心解答
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1楼 2010-04-27 10:15:33
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cy2003

新虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我也想计算配位键，刚接触gaussian什么都不知道，同lz一起等高手来指导
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2楼2010-04-28 19:09:36
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luxi_bg

新虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我也想计算配位键，高手快来支招啊
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3楼2010-04-29 00:06:43
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fooo

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
aylayl08(金币+2):谢谢提示 2010-04-29 16:33
如果分子不太大，直接优化不就可以了吗？为什么要固定呢？另外配位键也好，共价键也好，计算过程是一样的，软件并不认得这些键，它们是人自己分析出来的。
引用回帖:
Originally posted by letitgone at 2010-04-27 10:15:33:
各位大牛牛们好，我想要对一个螯合了Zn2+的小分子结构进行优化。
小分子与Zn2+之间是四配位键结合。
我查了以前的帖子，人家说用lanl2dz基组（#B3lyp/LANL2DZ）
但是我不知道Gaussian的一般步骤应该如何？是先 ...

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4楼2010-04-29 04:33:09
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jxzhao

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
aylayl08(金币+2):鼓励交流 2010-04-29 16:33
引用回帖:
Originally posted by letitgone at 2010-04-27 10:15:33:
各位大牛牛们好，我想要对一个螯合了Zn2+的小分子结构进行优化。
小分子与Zn2+之间是四配位键结合。
我查了以前的帖子，人家说用lanl2dz基组（#B3lyp/LANL2DZ）
但是我不知道Gaussian的一般步骤应该如何？是先 ...

我最近也在算！我认为直接优化就可以了，但是与你的初始结构有关系，而且与溶剂相也有很大关系，一般气相最容易！
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5楼2010-04-29 10:59:18
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letitgone

铁虫 (初入文坛)
哦哦，知道了。我先试试看再说。谢谢谢谢
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6楼2010-05-05 13:13:56
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mengfc

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我算过气相的，没固定原子，直接算~
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7楼2010-05-05 18:08:18
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sunhaitao

木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
直接优化，就好，干嘛要固定
我也做过此类计算
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一点一点进步！
8楼2010-05-06 09:39:50
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