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zouhui1115

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】用ms计算两个分子的相互作用势 已有9人参与

请问高手,ms能不能这样计算两个分子间的相互作用势呢?
譬如说想计算两个C60分子之间的相互作用势,
1建立两个C60分子组成的体系,然后用Dmol3计算体系的总能量E(total);
2用Dmol3计算单个C60的总能量E(C60)
3用两个C60分子的体系的总能量减去两个单个分子的能量,
即E(total)-2*E(C60)
这样是否可以准确的得出两个C60分子之间的相互作用势呢?谢谢大家.
貌似这样计算有些问题,例如,我计算了氮分子和氧分子之间的相互作用势,
分子之间的角度如下图所示,得出相互作用势和分子中心距离的曲线
红圈部分很奇怪,一般的势能曲线应该是不会出现这种起伏的吧,
希望高手指教,非常感谢!


[ Last edited by zouhui1115 on 2010-4-21 at 12:54 ]
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souledge

专家顾问 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
gavinliu7390(金币+1):谢谢交流! 2010-04-20 20:06
那个,不懂分子,一直学无机的,所以只能提个很外行的问题——相互作用势和分子间距离,以及两个分子的方向有关系么~~~~
思想重于技巧,内涵重于表象
2楼2010-04-20 18:30:39
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
xiaohunhun(金币+1):xiexie 2010-04-20 20:25
如果不考虑周期性边界条件, 这么做是没什么问题的。
真理是一点点接近的!
3楼2010-04-20 20:07:29
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ym23

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
qli0218(金币+1):谢谢 2010-04-22 09:13
引用回帖:
Originally posted by souledge at 2010-04-20 18:30:39:
那个,不懂分子,一直学无机的,所以只能提个很外行的问题——相互作用势和分子间距离,以及两个分子的方向有关系么~~~~

相互作用势与距离还有角度都有关,
因为相互作用势的表达式中有距离平方的倒数项,
对势即二体势不考虑角度,但更复杂的三体势就要考虑角度项了。
博观约取、厚积薄发---壁立千仞、无欲则刚
4楼2010-04-20 21:17:00
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ym23

铁杆木虫 (著名写手)


aylayl08(金币+1):感谢讨论 2010-04-22 10:09
楼主的做法得到是结合能,
似乎相互作用势不是这么定义的,我也不清楚该怎么算相互作用势,
我跟楼主一样,想知道MS如何得到相互作用势。
博观约取、厚积薄发---壁立千仞、无欲则刚
5楼2010-04-20 21:19:14
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aaq2800

铁杆木虫 (知名作家)


aylayl08(金币+1):感谢讨论 2010-04-22 10:09
相互作用势还能角度有关的,你这用MS算出来,再拟合出来的一个解析表达式应该很不准确的
6楼2010-04-20 21:21:34
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)


xiaohunhun(金币+1):xiexie 2010-04-21 00:12
楼主文中说的只是相互作用能,非相互作用势。
Anewday,anewhour,anewminute,anewpeople.
7楼2010-04-20 21:27:53
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zouhui1115

铁虫 (初入文坛)

怎么相互作用能不是相互作用势吗?按照我的理解应该是一样的啊
8楼2010-04-21 10:19:13
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zouhui1115

铁虫 (初入文坛)


aylayl08(金币+1):谢谢讨论 2010-04-22 10:09
相互作用势确实和分子之间的角度和间距有关系,有文献专门研究这个问题的,
而且貌似通过不同角度以及分子间距得到的数据可以拟合出一个解析表达式
9楼2010-04-21 10:27:05
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zouhui1115

铁虫 (初入文坛)

有没有高人能解释一下计算出来的图为什么会这样呢?
非常感谢!
10楼2010-04-22 08:22:27
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