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zouhui1115

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】用ms计算两个分子的相互作用势 已有9人参与

请问高手,ms能不能这样计算两个分子间的相互作用势呢?
譬如说想计算两个C60分子之间的相互作用势,
1建立两个C60分子组成的体系,然后用Dmol3计算体系的总能量E(total);
2用Dmol3计算单个C60的总能量E(C60)
3用两个C60分子的体系的总能量减去两个单个分子的能量,
即E(total)-2*E(C60)
这样是否可以准确的得出两个C60分子之间的相互作用势呢?谢谢大家.
貌似这样计算有些问题,例如,我计算了氮分子和氧分子之间的相互作用势,
分子之间的角度如下图所示,得出相互作用势和分子中心距离的曲线
红圈部分很奇怪,一般的势能曲线应该是不会出现这种起伏的吧,
希望高手指教,非常感谢!


[ Last edited by zouhui1115 on 2010-4-21 at 12:54 ]
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
xiaohunhun(金币+1):xiexie 2010-04-20 20:25
如果不考虑周期性边界条件, 这么做是没什么问题的。
真理是一点点接近的!
3楼2010-04-20 20:07:29
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souledge

专家顾问 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
gavinliu7390(金币+1):谢谢交流! 2010-04-20 20:06
那个,不懂分子,一直学无机的,所以只能提个很外行的问题——相互作用势和分子间距离,以及两个分子的方向有关系么~~~~
思想重于技巧,内涵重于表象
2楼2010-04-20 18:30:39
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ym23

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
qli0218(金币+1):谢谢 2010-04-22 09:13
引用回帖:
Originally posted by souledge at 2010-04-20 18:30:39:
那个,不懂分子,一直学无机的,所以只能提个很外行的问题——相互作用势和分子间距离,以及两个分子的方向有关系么~~~~

相互作用势与距离还有角度都有关,
因为相互作用势的表达式中有距离平方的倒数项,
对势即二体势不考虑角度,但更复杂的三体势就要考虑角度项了。
博观约取、厚积薄发---壁立千仞、无欲则刚
4楼2010-04-20 21:17:00
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ym23

铁杆木虫 (著名写手)


aylayl08(金币+1):感谢讨论 2010-04-22 10:09
楼主的做法得到是结合能,
似乎相互作用势不是这么定义的,我也不清楚该怎么算相互作用势,
我跟楼主一样,想知道MS如何得到相互作用势。
博观约取、厚积薄发---壁立千仞、无欲则刚
5楼2010-04-20 21:19:14
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