应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】ms模型原子坐标的导出
121/2返回列表12下一页
查看: 5156  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

enola

捐助贵宾 (正式写手)

[交流] 【求助】ms模型原子坐标的导出 已有6人参与

在ms里键了硅的惯用晶胞（conventional cell）,我数了下有18个可见的硅原子，可是我按照网上的方法，运算下ms，再导出坐标，剩下8个坐标，我想知道这之间的对应关系是什么啊？他的晶体结构类型是什么呢？scc，fcc。记得有个大侠跟我说过，我不是很懂
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
timeflies..
1楼 2010-04-11 11:06:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

enola

捐助贵宾 (正式写手)
★
zxzj05(金币+1):参与奖励！ 2010-10-01 20:28:42
引用回帖:
Originally posted by dingfengbo at 2010-09-29 09:33:55:

我想问一下用ms建了硅的惯用晶胞后，怎样导出坐标呢？我按网上说的先导出成.car文件，再用写字板打开，发现那里面的内容不是fractional 坐标！

ms里建好结构后，运行下castep，任务随便选，点stop，然后看输出文件里的.castep文件，你面有pwscf所要的详细信息：
*******************************************************************************
  

                           -------------------------------
                                      Unit Cell
                           -------------------------------
        Real Lattice(A)                      Reciprocal Lattice(1/A)
   9.9560000   0.0000000   0.0000000        0.6310954   0.0000000   0.0000000
   0.0000000   9.9560000   0.0000000        0.0000000   0.6310954   0.0000000
   0.0000000   0.0000000  13.8960000        0.0000000   0.0000000   0.4521578

                       Lattice parameters(A)       Cell Angles
                    a =    9.956000          alpha =   90.000000
                    b =    9.956000          beta  =   90.000000
                    c =   13.896000          gamma =   90.000000
赞一下(2人) 回复此楼
timeflies..
4楼2010-09-29 21:09:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dingfengbo

新虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by enola at 2010-09-29 21:09:43:

ms里建好结构后，运行下castep，任务随便选，点stop，然后看输出文件里的.castep文件，你面有pwscf所要的详细信息：
*******************************************************************************
  
...

谢谢！这种方法挺好用的！另外我还搜到：在MS中先建模型，然后点castep中的calculation，点击出现的对话框中的files，save files，最后在建的模型名上右击选择properties，复制文件的位置，在我的电脑中找到该文件所在文件夹，文件夹中有个.cell隐藏文件，用记事本打开就有坐标和基矢！
赞一下(2人) 回复此楼
5楼2010-10-01 14:24:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

lono75

铁杆木虫 (著名写手)
★
zxzj05(金币+1):3Q 2010-04-11 21:05
角上是1/8
面上是1/2
赞一下(1人) 回复此楼
由天命,成人事！
2楼2010-04-11 13:05:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dingfengbo

新虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by enola at 2010-04-11 11:06:46:
在ms里键了硅的惯用晶胞（conventional cell）,我数了下有18个可见的硅原子，可是我按照网上的方法，运算下ms，再导出坐标，剩下8个坐标，我想知道这之间的对应关系是什么啊？他的晶体结构类型是什么呢？scc，fcc ...

我想问一下用ms建了硅的惯用晶胞后，怎样导出坐标呢？我按网上说的先导出成.car文件，再用写字板打开，发现那里面的内容不是fractional 坐标！
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2010-09-29 09:33:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

enola

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by dingfengbo at 2010-10-01 14:24:34:

谢谢！这种方法挺好用的！另外我还搜到：在MS中先建模型，然后点castep中的calculation，点击出现的对话框中的files，save files，最后在建的模型名上右击选择properties，复制文件的位置，在我的电脑中找到该文 ...

哈哈。。多多交流
回复此楼
timeflies..
6楼2010-10-01 16:27:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

w511476842

银虫 (小有名气)
受教了
回复此楼
7楼2011-09-26 16:27:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lvyawei

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by enola at 2010-09-29 21:09:43
ms里建好结构后，运行下castep，任务随便选，点stop，然后看输出文件里的.castep文件，你面有pwscf所要的详细信息：
*******************************************************************************
  

...

我这边castep都run不了，不知道为什么
赞一下 回复此楼
8楼2014-10-14 15:57:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shoutingabc

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by lvyawei at 2014-10-14 15:57:46
我这边castep都run不了，不知道为什么...

我也是
回复此楼
9楼2018-01-22 20:31:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shoutingabc

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by dingfengbo at 2010-10-01 14:24:34
谢谢！这种方法挺好用的！另外我还搜到：在MS中先建模型，然后点castep中的calculation，点击出现的对话框中的files，save files，最后在建的模型名上右击选择properties，复制文件的位置，在我的电脑中找到该文件 ...

建立模型后，不可以直接导出.car或者.cif文件提取坐标吗？
赞一下 回复此楼
10楼2018-01-22 20:34:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 enola 的主题更新
121/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[文学芳草园] 伙伴们，祝我生日快乐吧 +17 myrtle 2026-03-10 26/1300 2026-03-16 18:32 by 青橙Ln
[考研] 环境工程调剂 +6 大可digkids 2026-03-16 6/300 2026-03-16 17:16 by barlinike
[考研] 一志愿985，本科211，0817化学工程与技术319求调剂 +5 Liwangman 2026-03-15 5/250 2026-03-16 17:10 by 我的船我的海
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
[考研] 材料与化工一志愿南昌大学327求调剂推荐 +7 Ncdx123456 2026-03-13 8/400 2026-03-16 12:15 by karry wen
[教师之家] 焦虑 +7 水冰月月野兔 2026-03-13 9/450 2026-03-16 10:00 by Quakerbird
[硕博家园] 深圳大学硕士招生（2026秋，传感器方向，仅录取第一志愿） +4 xujiaoszu 2026-03-11 8/400 2026-03-16 09:45 by xujiaoszu
[考研] 288求调剂 +4 奇点0314 2026-03-14 4/200 2026-03-14 23:04 by JourneyLucky
[基金申请] 现在如何回避去年的某一个专家，不知道名字 +3 zk200107 2026-03-12 6/300 2026-03-14 17:13 by zk200107
[考研] 环境调剂 +6 晓看天暮看云 2026-03-09 6/300 2026-03-14 01:16 by JourneyLucky
[考研] 一志愿湖师大化学289求调剂 +6 XMCMM3.14159 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:28 by JourneyLucky
[考研] b区环境工程求调剂 +4 Maps1 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:23 by JourneyLucky
[考研] 337一志愿华南理工0805材料求调剂 +7 mysdl 2026-03-11 9/450 2026-03-13 22:43 by JourneyLucky
[考研] 315求调剂 +9 小羊小羊_ 2026-03-11 10/500 2026-03-13 21:13 by SXNU李老师
[考研] 290求调剂 +7 ADT 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:17 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +3 程雨杭 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:06 by JourneyLucky
[考研] 工科0856专硕化学工程269能调剂吗 +10 我想读研11 2026-03-10 10/500 2026-03-13 10:14 by Yuyi.
[考研] 270求调剂 085600材料与化工专硕 +3 YXCT 2026-03-11 3/150 2026-03-13 10:13 by houyaoxu
[考博] 26申博求助 +3 跳跃饼干 2026-03-10 4/200 2026-03-10 21:15 by Tntcnn
[考研] 0703化学调剂 +3 三dd. 2026-03-10 3/150 2026-03-10 15:45 by peike
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭