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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】ms模型原子坐标的导出
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enola

捐助贵宾 (正式写手)

[交流] 【求助】ms模型原子坐标的导出 已有6人参与

在ms里键了硅的惯用晶胞（conventional cell）,我数了下有18个可见的硅原子，可是我按照网上的方法，运算下ms，再导出坐标，剩下8个坐标，我想知道这之间的对应关系是什么啊？他的晶体结构类型是什么呢？scc，fcc。记得有个大侠跟我说过，我不是很懂
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timeflies..
1楼 2010-04-11 11:06:46
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

enola

捐助贵宾 (正式写手)
★
zxzj05(金币+1):参与奖励！ 2010-10-01 20:28:42
引用回帖:
Originally posted by dingfengbo at 2010-09-29 09:33:55:

我想问一下用ms建了硅的惯用晶胞后，怎样导出坐标呢？我按网上说的先导出成.car文件，再用写字板打开，发现那里面的内容不是fractional 坐标！

ms里建好结构后，运行下castep，任务随便选，点stop，然后看输出文件里的.castep文件，你面有pwscf所要的详细信息：
*******************************************************************************
  

                           -------------------------------
                                      Unit Cell
                           -------------------------------
        Real Lattice(A)                      Reciprocal Lattice(1/A)
   9.9560000   0.0000000   0.0000000        0.6310954   0.0000000   0.0000000
   0.0000000   9.9560000   0.0000000        0.0000000   0.6310954   0.0000000
   0.0000000   0.0000000  13.8960000        0.0000000   0.0000000   0.4521578

                       Lattice parameters(A)       Cell Angles
                    a =    9.956000          alpha =   90.000000
                    b =    9.956000          beta  =   90.000000
                    c =   13.896000          gamma =   90.000000
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timeflies..
4楼2010-09-29 21:09:43
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dingfengbo

新虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by enola at 2010-09-29 21:09:43:

ms里建好结构后，运行下castep，任务随便选，点stop，然后看输出文件里的.castep文件，你面有pwscf所要的详细信息：
*******************************************************************************
  
...

谢谢！这种方法挺好用的！另外我还搜到：在MS中先建模型，然后点castep中的calculation，点击出现的对话框中的files，save files，最后在建的模型名上右击选择properties，复制文件的位置，在我的电脑中找到该文件所在文件夹，文件夹中有个.cell隐藏文件，用记事本打开就有坐标和基矢！
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5楼2010-10-01 14:24:34
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普通回帖

lono75

铁杆木虫 (著名写手)
★
zxzj05(金币+1):3Q 2010-04-11 21:05
角上是1/8
面上是1/2
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由天命,成人事！
2楼2010-04-11 13:05:31
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dingfengbo

新虫 (小有名气)
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
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Originally posted by enola at 2010-04-11 11:06:46:
在ms里键了硅的惯用晶胞（conventional cell）,我数了下有18个可见的硅原子，可是我按照网上的方法，运算下ms，再导出坐标，剩下8个坐标，我想知道这之间的对应关系是什么啊？他的晶体结构类型是什么呢？scc，fcc ...

我想问一下用ms建了硅的惯用晶胞后，怎样导出坐标呢？我按网上说的先导出成.car文件，再用写字板打开，发现那里面的内容不是fractional 坐标！
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3楼2010-09-29 09:33:55
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enola

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by dingfengbo at 2010-10-01 14:24:34:

谢谢！这种方法挺好用的！另外我还搜到：在MS中先建模型，然后点castep中的calculation，点击出现的对话框中的files，save files，最后在建的模型名上右击选择properties，复制文件的位置，在我的电脑中找到该文 ...

哈哈。。多多交流
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timeflies..
6楼2010-10-01 16:27:47
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w511476842

银虫 (小有名气)
受教了
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7楼2011-09-26 16:27:32
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lvyawei

金虫 (小有名气)
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4楼: Originally posted by enola at 2010-09-29 21:09:43
ms里建好结构后，运行下castep，任务随便选，点stop，然后看输出文件里的.castep文件，你面有pwscf所要的详细信息：
*******************************************************************************
  

...

我这边castep都run不了，不知道为什么
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8楼2014-10-14 15:57:46
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shoutingabc

新虫 (初入文坛)
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8楼: Originally posted by lvyawei at 2014-10-14 15:57:46
我这边castep都run不了，不知道为什么...

我也是
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9楼2018-01-22 20:31:13
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shoutingabc

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by dingfengbo at 2010-10-01 14:24:34
谢谢！这种方法挺好用的！另外我还搜到：在MS中先建模型，然后点castep中的calculation，点击出现的对话框中的files，save files，最后在建的模型名上右击选择properties，复制文件的位置，在我的电脑中找到该文件 ...

建立模型后，不可以直接导出.car或者.cif文件提取坐标吗？
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10楼2018-01-22 20:34:38
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