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【原创】ABINIT的一种晶体结构建模方法
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以前，在论坛上看到不少帖子，ABINIT的建模方法都是采用natom+rprim+xred+acell来进行建模的，这包括abinit的说明中的例子也是这样。因此，这需要预先用MS建立晶体结构，然后make P1，再导出坐标，然后才能计算。 这里，介绍一种用natom+natrd+spgroup+brvltt+acell+angdeg+xred进行建模的方法 这种建模方法和MS的利用空间群和等效的晶体学位置进行建模的方式是一致的，个人感觉挺方便的。 具体参数的意义可在www.abinit.org中找到。 以PRL 100，186402的一篇文章为例，La2NiMnO6的晶体学数据如下表所示  我们用Monoclinic型为例子，其晶胞有20个原子，因此建模部分如下 spgroup 14 ntypat 57 28 25 8 natom 20 brvltt -1 natrd 6 #读入的原子数目，就是晶体学数据给出的有坐标的原子数目 typat 1 2 3 4 4 4 #表中给出的Monoclinic型La2NiMnO6晶体的数据分别是 # La Ni Mn O1 O2 O3 acell 5.467 5.510 7.751 Angstrom #用埃做单位后面要加上Angstrom #也可用Bohr做单位 angdeg 90.000 90.119 90.000 xred  [ Last edited by identation on 2010-4-8 at 23:57 ] |
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27楼2018-08-23 11:33:15
★★★ 三星级,支持鼓励
★ ★ ★
wuli8(金币+1):感谢交流 2010-04-10 19:21
ym23(金币+2):欢迎常来交流 2010-09-07 22:24:28
wuli8(金币+1):感谢交流 2010-04-10 19:21
ym23(金币+2):欢迎常来交流 2010-09-07 22:24:28
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（1）这种方法是采用 crystal builder 方法。 必须保证 spgroup不等于0。也就是说必须自己设定值，abinit默认为0。我看你的input里面没有输入 （2）这种方法的缺点是：对于掺杂（特别是无序），这种输入方式无法建模。 只能用unit cell 或者primitive cell (对于个别有序情况) 全部原子输入方式 [ Last edited by wenjlu on 2010-4-8 at 22:12 ] |
5楼2010-04-08 22:10:53
6楼2010-04-09 09:14:24
8楼2010-04-24 13:45:55
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