24小时热门版块排行榜    

查看: 5381  |  回复: 26
【奖励】 本帖被评价13次,作者identation增加金币 9.8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

[资源] 【原创】ABINIT的一种晶体结构建模方法

以前,在论坛上看到不少帖子,ABINIT的建模方法都是采用natom+rprim+xred+acell来进行建模的,这包括abinit的说明中的例子也是这样。因此,这需要预先用MS建立晶体结构,然后make P1,再导出坐标,然后才能计算。
这里,介绍一种用natom+natrd+spgroup+brvltt+acell+angdeg+xred进行建模的方法
这种建模方法和MS的利用空间群和等效的晶体学位置进行建模的方式是一致的,个人感觉挺方便的。
具体参数的意义可在www.abinit.org中找到。
以PRL 100,186402的一篇文章为例,La2NiMnO6的晶体学数据如下表所示



我们用Monoclinic型为例子,其晶胞有20个原子,因此建模部分如下
spgroup 14
ntypat 57 28 25 8
natom 20
brvltt -1
natrd 6 #读入的原子数目,就是晶体学数据给出的有坐标的原子数目
typat 1 2 3 4 4 4 #表中给出的Monoclinic型La2NiMnO6晶体的数据分别是
                             # La Ni  Mn  O1 O2 O3
acell 5.467 5.510 7.751 Angstrom     #用埃做单位后面要加上Angstrom
                                                          #也可用Bohr做单位
angdeg 90.000 90.119 90.000
xred


[ Last edited by identation on 2010-4-8 at 23:57 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

Abinit 相关资料 有意思的 Abinit及相关小程序

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

frank_zhan

金虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by fzx2008 at 2010-04-24 13:45:55:
这个方法有的时候很好使,直接敲很少的原子坐标输入就行了。
但是对No.14群用的时候有问题。
希望能一起讨论

请教一下对单壁碳纳米管怎么建模呢?
25楼2010-12-14 23:00:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 27 个回答

wenjlu

木虫 (正式写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

★ ★ ★
wuli8(金币+1):感谢交流 2010-04-10 19:21
ym23(金币+2):欢迎常来交流 2010-09-07 22:24:28
(1)这种方法是采用 crystal builder 方法。 必须保证 spgroup不等于0。也就是说必须自己设定值,abinit默认为0。我看你的input里面没有输入

(2)这种方法的缺点是:对于掺杂(特别是无序),这种输入方式无法建模。 只能用unit cell 或者primitive cell (对于个别有序情况) 全部原子输入方式

[ Last edited by wenjlu on 2010-4-8 at 22:12 ]
5楼2010-04-08 22:10:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

非天之翼蓝羽

金虫 (初入文坛)


★★★ 三星级,支持鼓励

同样的建立结构方式。。
6楼2010-04-09 09:14:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ym23(金币+1):欢迎常来交流 2010-09-07 22:24:37
这个方法有的时候很好使,直接敲很少的原子坐标输入就行了。
但是对No.14群用的时候有问题。
希望能一起讨论
8楼2010-04-24 13:45:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
☆ 无星级 ★ 一星级 ★★★ 三星级 ★★★★★ 五星级
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 申请回稿延期一个月,编辑同意了。但系统上的时间没变,给编辑又写邮件了,没回复 10+3 wangf9518 2026-03-17 4/200 2026-03-19 23:55 by babero
[考研] 一志愿苏州大学材料求调剂,总分315(英一) +3 sbdksD 2026-03-19 3/150 2026-03-19 23:21 by fmesaito
[考研] 085600材料与化工 求调剂 +14 enenenhui 2026-03-13 15/750 2026-03-19 21:53 by allen-yin
[考研] 一志愿南京理工大学085701资源与环境302分求调剂 +3 葵梓卫队 2026-03-18 5/250 2026-03-19 19:35 by 给你你注意休息
[考研] 求调剂 +3 Mqqqqqq 2026-03-19 3/150 2026-03-19 14:11 by peike
[考研] 求调剂,一志愿:南京航空航天大学大学 ,080500材料科学与工程学硕,总分289分 +3 @taotao 2026-03-19 3/150 2026-03-19 14:07 by peike
[考研] 材料考研调剂 +3 xwt。 2026-03-19 3/150 2026-03-19 11:22 by w沐阳w
[考研] 一志愿985,本科211,0817化学工程与技术319求调剂 +10 Liwangman 2026-03-15 10/500 2026-03-19 10:25 by 无际的草原
[考研] 330求调剂 +3 小材化本科 2026-03-18 3/150 2026-03-18 21:55 by 无懈可击111
[考研] 328求调剂,英语六级551,有科研经历 +3 生物工程调剂 2026-03-17 7/350 2026-03-18 20:41 by Wangjingyue
[考研] 0854,计算机类招收调剂 +3 胡辣汤放糖 2026-03-15 6/300 2026-03-18 12:09 by 上岸上岸……..
[考研] 293求调剂 +11 zjl的号 2026-03-16 16/800 2026-03-18 08:10 by zhukairuo
[考研] 301求调剂 +4 A_JiXing 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:32 by ruiyingmiao
[考研] 一志愿南京大学,080500材料科学与工程,调剂 +4 Jy? 2026-03-16 4/200 2026-03-17 11:02 by gaoqiong
[考研] [导师推荐]西南科技大学国防/材料导师推荐 +3 尖角小荷 2026-03-16 6/300 2026-03-16 23:21 by 尖角小荷
[考研] 304求调剂 +4 ahbd 2026-03-14 4/200 2026-03-16 16:48 by 我的船我的海
[考研] 0703化学调剂 290分有科研经历,论文在投 +7 腻腻gk 2026-03-14 7/350 2026-03-16 10:12 by houyaoxu
[考研] 26考研一志愿中国石油大学(华东)305分求调剂 +3 嘉年新程 2026-03-15 3/150 2026-03-15 13:58 by 哈哈哈哈嘿嘿嘿
[考研] 070305求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-14 4/200 2026-03-15 11:04 by peike
[考研] 招收0805(材料)调剂 +3 18595523086 2026-03-13 3/150 2026-03-14 00:33 by 123%、
信息提示
请填处理意见