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microdiag

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【原创】最新HRM技术,应用于SNP、突变和甲基化的检测已有2人参与

现在大多临床医生没有时间完成具体实验,可以尝试外包给技术服务公司,苏州为真推出的基于HRM技术的SNP、突变和甲基化检测的技术服务,能够帮助各位老师高质量完成大量样本的检测。
现阶段,大家检测SNP时都用一贯的检测方法,包括测序,探针还有DHPLC等等,而甲基化大多用MSP.至于HRM技术(高分辨率溶解曲线技术)并不为大家所熟知,有两个原因:1)适合做HRM技术的仪器太少了,而且在国内的普及程度不高,具我了解能够做HRM的有Roche LightCycler 480,Qiagen Roter-Gene 6000,ABI 7500 Fast和ABI7900HT Fast,Idaho LightScanncer.其中罗氏的480在其软件分析上是做的最好的.2)HRM的实验灵敏度太高,影响实验因素过多,很多人都做了,但是就是做不出来.因此就放弃,就换用其他比较成熟的方法.殊不知,HRM技术的检测方法有其他技术难以比拟的优势,不仅能实现高通量和高精度的同时,PCR和荧光定量在同一管内进行,能够有效避免假阳性.
作为新一代的遗传扫描工具,HRM具有"简,效,快,廉"等其他技术难以比拟的优势:
简:无需序列特异性探针,不受碱基位点局限,同时检出已知或未知突变、SNP和甲基化位点:闭管操作,避免交叉污染。
效:最低检测0.1%-0,01%的突变或异常甲基化,检测SNP灵敏度和特异性均为100%。
快:1次同时不多于384个样本,在60-90分钟内完成检测。
廉:简化操作步骤、降低人工和试剂成本,费用远少于测序、Taqman探针等方法。
HRM技术特别适用于样本量多、检测位点较少的SNP、突变或甲基化分析,是不同于基因芯片检测方法(检测位点多,样本少)的高通量方法。同时,也是基因芯片筛选后的多个基因在更多标本中验证的最佳方法。
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基于HRM技术的SNP、突变和甲基化检测
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yifeng813

铜虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
分析HRM结果的软件使用介绍有吗? 我想试试这个方法呢。
那么多的恨意,怎一个情字了得?
2楼2010-07-06 16:50:07
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microdiag

铁虫 (初入文坛)

请问你是做什么的呢?SNP,突变还是甲基化?
基于HRM技术的SNP、突变和甲基化检测
3楼2010-07-07 09:45:57
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