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yucheng9255

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】新手请教如何对不同物种中某一酶的氨基酸序列进行比对再设计简并引物啊� 已有9人参与

我想克隆一个酶的基因,在其它物种中有。基本思路是,先分析找到在不同物种中的氨基酸保守序列,再根据其设计简并引物,扩增出基因的保守序列,再通过3'、5'RACE扩增出全长。好象也就是所谓的同源克隆吧。但是如何对该酶在不同物种中进行氨基酸比对,从而筛选出在不同物种中具有高度保守的序列呢?我在用clustalx进行多序列比对,寻找保守序列时,怎么通过比对确定哪些是我需要的保守序列?有没有软件直接帮我查找出保守序列? 如果有多个保守区域,我又如何确定选择哪个保守序列进行设计引物???
我刚接触分子,不怎么懂。问实验室的师兄师姐们,不知道是觉得太简单呢,还是也不懂,反正也说不出个所以然。
在此请教各位高手了!请不要见笑啊!
再次感谢!
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潘meiqiao

新虫 (初入文坛)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
简并引物不是万能 尽量还是用有特异性的
另外要设计简并引物 对比的序列一定要多 不然很容易白费 没有用
9楼2015-07-10 19:39:07
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anny66cb

银虫 (小有名气)

帮着顶,沙发!!!
2楼2010-02-17 23:01:04
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bihaiqingt

金虫 (小有名气)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
也希望知道具体方法啊
3楼2010-04-27 21:21:56
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yuyixst

木虫 (正式写手)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
比对出来保守区域不是很直观了么
4楼2010-04-27 22:10:31
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