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yucheng9255木虫 (著名写手)
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[交流]
【求助/交流】新手请教如何对不同物种中某一酶的氨基酸序列进行比对再设计简并引物啊� 已有9人参与
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我想克隆一个酶的基因，在其它物种中有。基本思路是，先分析找到在不同物种中的氨基酸保守序列，再根据其设计简并引物，扩增出基因的保守序列，再通过3'、5'RACE扩增出全长。好象也就是所谓的同源克隆吧。但是如何对该酶在不同物种中进行氨基酸比对，从而筛选出在不同物种中具有高度保守的序列呢？我在用clustalx进行多序列比对,寻找保守序列时，怎么通过比对确定哪些是我需要的保守序列？有没有软件直接帮我查找出保守序列？ 如果有多个保守区域,我又如何确定选择哪个保守序列进行设计引物？？？ 我刚接触分子，不怎么懂。问实验室的师兄师姐们，不知道是觉得太简单呢，还是也不懂，反正也说不出个所以然。 在此请教各位高手了！请不要见笑啊！ 再次感谢！ |
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hc1027
木虫 (正式写手)
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