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听雪看山

木虫 (职业作家)

西游家族之T所长

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[交流] 【求助/交流】单酶切载体竟然没切开,寻求原因?? 已有5人参与

我用的载体是5500bp,酶是XmaI,去过磷酸化的。这个酶切已经做过n多次了,插入基因就是没办法和载体连接上,自连现象严重。当时以为是去磷酸化步骤的问题,然后就做过2次去磷酸化。
     后来在做完酶切后做了一个转化,将50ng酶切液用电子穿孔仪转入感受态细胞,隔夜培养后发现n多菌斑,那就是意味着没有酶切成功,心里这个郁闷啊!
     我用的这个酶据说是比较难反应的,所以当时酶切都是隔夜至少10个小时以上了!!

     我现在真的是一点办法也没有了,本来就是新手,第一次做,竟然还碰到这么大的问题,3个月了,一点进展都没有,着急啊!
     恳请高手们给点建议,小虾米在这多谢了!!
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听雪看山

木虫 (职业作家)

西游家族之T所长

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引用回帖:
Originally posted by liyong1981 at 2010-05-05 11:09:49:
顶住。不要急~

谢谢,经过好几个月,酶切没有问题了。因为用的XmaI在说明里要酶切过夜(16小时)才有更强的效力,后来做出了阳性克隆。

现在问题在于,用了高保真的酶做PCR的,可是3次测序回来序列都不理想,第一次的有一个突变点,第二次和第三次序列里居然出现了内含子。
超郁闷,按理来说cDNA克隆,不应该有内含子的,可是出现了!!不只是必然还是偶然??
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16楼2010-05-05 17:41:06
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

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听雪看山(金币+1):谢谢参与
这个酶还可以啊,不是那么的难切,载体酶切后要用CIP去磷酸化一下,你的去磷酸化石如何处理的?
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2010-02-08 22:04:25
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听雪看山

木虫 (职业作家)

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引用回帖:
Originally posted by gyesang at 2010-02-08 22:04:25:
这个酶还可以啊,不是那么的难切,载体酶切后要用CIP去磷酸化一下,你的去磷酸化石如何处理的?

我用SAP,是Promega公司的。怀疑过去磷酸化出状况,可是现在貌似状况在酶切上。
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3楼2010-02-08 22:25:47
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biogefart

木虫 (著名写手)


听雪看山(金币+1):谢谢参与
这种情况换个其他公司的酶试试
闹太套
4楼2010-02-09 01:22:17
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