| 查看: 875 | 回复: 7 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
[交流]
【求助/交流】cDNA全长判断问题
|
|||
| 遇到难题了：我用RACE方法做的克隆，但是不知道5‘端是否到头啦，3’端有polyA结构，但是5‘端的帽子结构该怎么来判断呢？ |
回复此楼» 猜你喜欢
323求调剂
已经有6人回复
-
一志愿北京化工大学 070300 学硕 336分 求调剂
已经有4人回复
-
352求调剂
已经有3人回复
-
一志愿东华大学化学070300，求调剂
已经有8人回复
-
277材料科学与工程080500求调剂
已经有7人回复
-
317求调剂
已经有18人回复
-
293求调剂
已经有5人回复
-
280分求调剂 一志愿085802
已经有7人回复
-
0854电子信息求调剂
已经有3人回复
-
263求调剂
已经有4人回复
yujiaping1
木虫 (著名写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1365.2
- 散金: 10
- 红花: 5
- 帖子: 1174
- 在线: 66.6小时
- 虫号: 929883
- 注册: 2009-12-17
- 性别: MM
- 专业: 疫苗学
2楼2010-01-20 15:09:48
3楼2010-01-20 15:28:54
yujiaping1
木虫 (著名写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1365.2
- 散金: 10
- 红花: 5
- 帖子: 1174
- 在线: 66.6小时
- 虫号: 929883
- 注册: 2009-12-17
- 性别: MM
- 专业: 疫苗学
4楼2010-01-20 15:42:02
hugang2004_2000
木虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 2022
- 散金: 325
- 红花: 2
- 帖子: 671
- 在线: 201.5小时
- 虫号: 263575
- 注册: 2006-07-02
- 性别: GG
- 专业: 植物学
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
司马诸葛(金币+2): 1-25 14:39
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
司马诸葛(金币+2): 1-25 14:39
| 我觉得是要一点经验的，毕竟5‘的帽子结构不是总能得到的，所以即使到了接头引物序列，也不一定就是全长，虽然现在有的试剂盒专门针对5’的ggg设计了接头，但是ggg的序列不是那么特异，所以还是可能错配。我的经验是：知道了序列之后，去blastx，然后根据结果分析是不是到头了，如果有相似的已经报道的基因跟你的序列非常像，并且是从头开始的，那可以认为你的基因就是全长了；如果不是从头开始的，比如从第六个氨基酸开始，那就从对应的那个碱基开始往5'UTR的方向数，看是不是大约数了5组三联码就到了ATG，如果是的话，恭喜你，5‘到头了。呵呵，这是我的经验，不一定全部适应，可以参考。 |
5楼2010-01-20 15:42:23
zzhlibin
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 216.4
- 散金: 20
- 帖子: 54
- 在线: 24.6小时
- 虫号: 942385
- 注册: 2010-01-14
- 性别: GG
- 专业: 植物化学保护
6楼2010-01-24 09:51:20
7楼2010-01-25 16:02:00
8楼2010-01-25 22:36:21
