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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【求助/交流】cDNA全长判断问题
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yoyoyehan

[交流] 【求助/交流】cDNA全长判断问题

遇到难题了：我用RACE方法做的克隆，但是不知道5‘端是否到头啦，3’端有polyA结构，但是5‘端的帽子结构该怎么来判断呢？
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1楼 2010-01-20 15:02:51
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zzhlibin

银虫 (小有名气)
★
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引用回帖:
Originally posted by hugang2004_2000 at 2010-1-20 15:42:
我觉得是要一点经验的，毕竟5‘的帽子结构不是总能得到的，所以即使到了接头引物序列，也不一定就是全长，虽然现在有的试剂盒专门针对5’的ggg设计了接头，但是ggg的序列不是那么特异，所以还是可能错配。我的经验 ...

好经验，借鉴一下！
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6楼2010-01-24 09:51:20
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yujiaping1

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
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1949stone(金币+2,VIP+0): 1-20 15:38
你不是有5‘RACE的引物，是否含有引物序列你应该知道啊，如果含有引物序列就表示已经到头了，然后去掉人为加上的序列，就是实际基因的开头了
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2楼2010-01-20 15:09:48
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yoyoyehan

引用回帖:
Originally posted by yujiaping1 at 2010-1-20 15:09:
你不是有5‘RACE的引物，是否含有引物序列你应该知道啊，如果含有引物序列就表示已经到头了，然后去掉人为加上的序列，就是实际基因的开头了

请问你说的引物序列是试剂盒里带的UPM么？
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3楼2010-01-20 15:28:54
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yujiaping1

木虫 (著名写手)
★
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是的，你在用clontech的盒子，那就是了
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4楼2010-01-20 15:42:02
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