应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【求助/交流】cDNA全长判断问题
81/1返回列表
查看: 949  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

yoyoyehan

[交流] 【求助/交流】cDNA全长判断问题

遇到难题了：我用RACE方法做的克隆，但是不知道5‘端是否到头啦，3’端有polyA结构，但是5‘端的帽子结构该怎么来判断呢？
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2010-01-20 15:02:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yujiaping1

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
1949stone(金币+2,VIP+0): 1-20 15:38
你不是有5‘RACE的引物，是否含有引物序列你应该知道啊，如果含有引物序列就表示已经到头了，然后去掉人为加上的序列，就是实际基因的开头了
赞一下(11人) 回复此楼
2楼2010-01-20 15:09:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yoyoyehan

引用回帖:
Originally posted by yujiaping1 at 2010-1-20 15:09:
你不是有5‘RACE的引物，是否含有引物序列你应该知道啊，如果含有引物序列就表示已经到头了，然后去掉人为加上的序列，就是实际基因的开头了

请问你说的引物序列是试剂盒里带的UPM么？
赞一下 回复此楼
3楼2010-01-20 15:28:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yujiaping1

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
是的，你在用clontech的盒子，那就是了
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-01-20 15:42:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hugang2004_2000

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
司马诸葛(金币+2): 1-25 14:39
我觉得是要一点经验的，毕竟5‘的帽子结构不是总能得到的，所以即使到了接头引物序列，也不一定就是全长，虽然现在有的试剂盒专门针对5’的ggg设计了接头，但是ggg的序列不是那么特异，所以还是可能错配。我的经验是：知道了序列之后，去blastx，然后根据结果分析是不是到头了，如果有相似的已经报道的基因跟你的序列非常像，并且是从头开始的，那可以认为你的基因就是全长了；如果不是从头开始的，比如从第六个氨基酸开始，那就从对应的那个碱基开始往5'UTR的方向数，看是不是大约数了5组三联码就到了ATG，如果是的话，恭喜你，5‘到头了。呵呵，这是我的经验，不一定全部适应，可以参考。
赞一下(11人) 回复此楼
5楼2010-01-20 15:42:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zzhlibin

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by hugang2004_2000 at 2010-1-20 15:42:
我觉得是要一点经验的，毕竟5‘的帽子结构不是总能得到的，所以即使到了接头引物序列，也不一定就是全长，虽然现在有的试剂盒专门针对5’的ggg设计了接头，但是ggg的序列不是那么特异，所以还是可能错配。我的经验 ...

好经验，借鉴一下！
回复此楼
6楼2010-01-24 09:51:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jasco

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by hugang2004_2000 at 2010-01-20 15:42:23:
我觉得是要一点经验的，毕竟5‘的帽子结构不是总能得到的，所以即使到了接头引物序列，也不一定就是全长，虽然现在有的试剂盒专门针对5’的ggg设计了接头，但是ggg的序列不是那么特异，所以还是可能错配。我的经验 ...

学习经验，谢谢！
回复此楼
7楼2010-01-25 16:02:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gastrodia

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
把你的cDNA全长翻译一下，只有一个阅读框是正确的，我是用在线翻译translateDNA,下图中只有第一种翻译情况是全长，在起始密码子前找到终止子即可，当然要保证你dna没突变，测序没问题，拿蛋白质去blast，看看blast到的那些物种此蛋白长度如何，即可判断
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2010-01-25 22:36:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yoyoyehan 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 提交了我也来说说感想 +6 fummck 2026-05-20 6/300 2026-05-20 17:29 by 姜太公烤鱼
[论文投稿] Sci. Bull. 悲剧经验 +6 jyang1999 2026-05-16 7/350 2026-05-20 16:39 by feng6531
[基金申请] 今年审到国自然15份，谈谈感受 +19 国自然国社科中 2026-05-17 20/1000 2026-05-20 14:14 by 仲夏夜的星星
[基金申请] 国自然评分 +3 无名者登山 2026-05-20 4/200 2026-05-20 13:29 by vito刘
[有机交流] 反应很差，大量原料没有反应 5+3 Mr.Zot 2026-05-19 6/300 2026-05-20 10:36 by xtlilibin
[考博] 如果工作了想读博，可以边工作边读全日制嘛？ 30+3 铁达火车 2026-05-18 5/250 2026-05-20 09:33 by tfang
[有机交流] 如何实现卤原子转化 +3 BT20230424 2026-05-15 8/400 2026-05-20 09:32 by xtlilibin
[基金申请] 河北省自然科学基金 +3 Peterchao 2026-05-18 3/150 2026-05-20 08:57 by 霸_霸
[教师之家] 上海大学实验技术岗位非升即走 +12 嘻嘻哈哈乐呵呵 2026-05-15 13/650 2026-05-20 08:34 by xli1984
[考博] 云南大学材料与能源学院解琳课题组钙钛矿博士招生 +3 光伏爱好者 2026-05-17 5/250 2026-05-19 19:13 by 光伏爱好者
[考博] 26/27申博自荐-锂/钠电池方向 5+3 狗头军师. 2026-05-15 4/200 2026-05-19 09:10 by moonboat
[基金申请] 同样的基金本子，换个专家直接从C变A！ (金币-10) +3 国自然国社科中 2026-05-19 3/150 2026-05-19 08:50 by Equinoxhua
[基金申请] 别被青基扩招骗了！26年科研内卷才刚刚开始 +3 国自然国社科中 2026-05-14 4/200 2026-05-19 08:48 by archvillain
[考博] 2026博士还有哪些学校有名额 +7 小王求读研 2026-05-15 8/400 2026-05-19 08:27 by zhyzzh
[考博] 博士申请 +5 星…… 2026-05-18 6/300 2026-05-18 23:49 by 糊糊涂涂好
[硕博家园] 我在等一个没有答案的答案 +3 Love_MH 2026-05-17 3/150 2026-05-18 02:22 by 竹林孤影
[文学芳草园] 半夜喝咖啡 +3 myrtle 2026-05-15 5/250 2026-05-18 01:03 by 小沈2018
[考博] 光量子物理方向 博士招生 1人（2026.09） +3 sandyworld 2026-05-15 4/200 2026-05-17 14:38 by sandyworld
[有机交流] 求助2，4-二氯-5-嘧啶甲醛的合成方法 20+3 光吃不拉 2026-05-14 6/300 2026-05-16 19:46 by Equinoxhua
[考博] 26应届毕业生考博求助 +3 wo一定上岸 2026-05-13 3/150 2026-05-14 21:47 by 明海天涯
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭