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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【求助/交流】cDNA全长判断问题
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yoyoyehan

[交流] 【求助/交流】cDNA全长判断问题

遇到难题了：我用RACE方法做的克隆，但是不知道5‘端是否到头啦，3’端有polyA结构，但是5‘端的帽子结构该怎么来判断呢？
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1楼 2010-01-20 15:02:51
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gastrodia

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
把你的cDNA全长翻译一下，只有一个阅读框是正确的，我是用在线翻译translateDNA,下图中只有第一种翻译情况是全长，在起始密码子前找到终止子即可，当然要保证你dna没突变，测序没问题，拿蛋白质去blast，看看blast到的那些物种此蛋白长度如何，即可判断
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8楼2010-01-25 22:36:21
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yujiaping1

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
1949stone(金币+2,VIP+0): 1-20 15:38
你不是有5‘RACE的引物，是否含有引物序列你应该知道啊，如果含有引物序列就表示已经到头了，然后去掉人为加上的序列，就是实际基因的开头了
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2楼2010-01-20 15:09:48
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yoyoyehan

引用回帖:
Originally posted by yujiaping1 at 2010-1-20 15:09:
你不是有5‘RACE的引物，是否含有引物序列你应该知道啊，如果含有引物序列就表示已经到头了，然后去掉人为加上的序列，就是实际基因的开头了

请问你说的引物序列是试剂盒里带的UPM么？
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3楼2010-01-20 15:28:54
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yujiaping1

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
是的，你在用clontech的盒子，那就是了
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4楼2010-01-20 15:42:02
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