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【求助/交流】关于DNA测序问题
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qing1985
金虫
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虫号: 304064
注册: 2006-12-09
专业: 生物大分子结构与功能
[交流]
【求助/交流】关于DNA测序问题
有哪位大虾可以帮下忙,帮小弟解决些问题:
我将样品用切胶的方法来纯化,用OMEGA的试剂盒来回收,但送去测序的时候老是出现信号衰减,请问是什么原因啊?
[
Last edited by amisking on 2009-12-26 at 13:00
]
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1楼
2009-12-26 12:14:29
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adom2009
铁杆木虫
(正式写手)
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帖子: 646
在线: 145.4小时
虫号: 884410
注册: 2009-10-26
专业: 病毒学
可能是样品模板加过多,即模板浓度相对过高,导致小片段过多,形成提前衰落
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10楼
2010-01-02 12:11:03
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09021122
木虫
(正式写手)
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红花: 1
沙发: 1
帖子: 518
在线: 113.5小时
虫号: 856621
注册: 2009-09-25
性别: GG
专业: 系统生物学
★ ★ ★ ★ ★
amisking(金币
+5
,VIP
+0
):
12-26 13:01
一:纯化后有没有检测,看看条带的亮度如何.
二:DNA片段的长度是多少?如果很长的话,可能测不通。
三:测序引物是否有问题。
四:建议最好做克隆,因为可能后的测序效果很好,而且较准确。
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雄关漫道真如铁,而今迈步从头越
2楼
2009-12-26 12:58:39
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bioxixi
木虫
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虫号: 662656
注册: 2008-11-26
性别:
MM
专业: 细胞生物学
★
1949stone(金币
+1
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):
12-26 19:20
PCR产物直接测序?
建议做TA克隆,鉴定后测序
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3楼
2009-12-26 13:39:36
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genomelin
银虫
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注册: 2006-12-02
性别: GG
专业: 基因表达调控与表观遗传学
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
1949stone(金币
+2
,VIP
+0
):谢谢交流
12-26 19:21
qing1985(金币
+5
,VIP
+0
):
1-7 15:01
可能是你的模板前段有复杂的二级结构,送去测序的时候让公司多加点ET或者直接用BigDye做测序反应,也有可能是测序反应的时候引物量少了,反应后的小片段过多,也会有衰减的现象
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(14人)
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4楼
2009-12-26 13:44:28
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