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【交流/求助】克隆基因全长问题2
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llzhang2012
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[交流]
【交流/求助】克隆基因全长问题2
我对一个已知基因序列进行全长克隆,测序后结果得到的序列只是已知序列的前一部分,全长有1400多bp,但我做出来的只有前面的大概800多bp,请问这是什么原因?
实验过程中电泳结果都挺好的,酶切结果也是对的,测序后就不行了,是不是失败了?
谢谢
[
Last edited by amisking on 2009-12-12 at 21:47
]
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2009-12-02 11:09:43
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+0.5
):给个红包,谢谢回帖交流
1949stone(金币
+1
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+0
):谢谢交流
12-2 11:36
你可以设计多段引物克隆片段,然后载拼接在一起就可以了。
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2楼
2009-12-02 11:29:06
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小木虫(金币
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):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币
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):
12-2 12:32
做全长是不是应该用RACE啊,5‘ 3’分开做。
楼主的意思是你PCR出来的片段是1400bp测序出来只有700?这个不太可能吧?你连进T载后有没有做一下酶切验证?
PS:一个测序反应的有效读长大概只有700-800BP,1400bp需要正相反相两个反应才能测通。
NCBI上的很多预测序列很多都是不准的,我师兄做过一个基因,实际扩出来的就比NCBI上的短很多,后来发现预测序列里多了一段内含子。
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2009-12-02 12:16:20
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专业: 植物生理与生化
用primer walking技术啊
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2009-12-02 16:43:03
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zhuifeng7000
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要测两个反应。
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2009-12-02 18:09:40
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你测了几个反应啊,一个反应大概只能测七八百个碱基,要加一个反应
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6楼
2009-12-12 21:27:59
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