应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【在线答疑】UCSF DOCK分子对接和虚拟筛选
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
433/5返回列表上一页12345下一页
查看: 7052  |  回复: 42
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
本帖产生 1 个 模拟EPI ，点击这里进行查看

wanglkaca

银虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我想问一下 这个autodock软件可以做DNA和小分子药物的对接吗？谢谢！
赞一下(1人) 回复此楼
21楼2010-07-14 21:38:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

javacfish

金虫 (小有名气)
★ ★
lei0736(金币+2):谢谢 2010-07-15 22:02:17
引用回帖:
Originally posted by wanglkaca at 2010-07-14 21:38:20:
我想问一下 这个autodock软件可以做DNA和小分子药物的对接吗？谢谢！

可以
回复此楼
22楼2010-07-15 09:10:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yscot

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
谢谢分享 收藏学习了~
回复此楼
23楼2010-07-31 19:27:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liukarl

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+1):谢谢 2010-10-05 19:07:39
DOCK 6 is distributed for Unix versions compatible with the MPICH library, Linux, Windows, and MacIntosh OSX systems.
DOCK 5 is distributed for Unix versions compatible with the MPICH library, Linux, Windows, and MacIntosh OSX systems.
DOCK 4 is distributed for Unix and Linux systems
DOCK 3 is distributed as source code only
Legacy Accessories available with previous versions of DOCK are distributed as source code only
赞一下(2人) 回复此楼
敢为天下鲜
24楼2010-10-05 12:37:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
请问一下JAVA兄，当我从ZINC里分割出一部分物质做虚拟筛选时，如何能保证比较高的准确率呢？还有，如果我在数据库搜索时，想去掉所有含氯原子的物质，不知道是否有简便的方法？谢谢
赞一下(1人) 回复此楼
25楼2010-10-09 07:53:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunyinxue

新虫 (初入文坛)

批量处理小分子

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by javacfish at 2009-11-30 16:20:36:
大家好，

大家都知道ZINC数据库在药物设计中的重要地位，而USCF DOCK(http://dock.compbio.ucsf.edu/)是针对ZINC数据库设计的，它有很多优点

1.很简单的实现平行编译，而autodock需要用DOVIS,或 ...

请问怎么批量处理小分子配体文件？
赞一下(1人) 回复此楼
26楼2010-12-29 14:48:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

houxuben

木虫 (正式写手)

MEDCHEM03
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
一个??问题，为何我从zinc库???能下到???索结果的??6400个分??？
赞一下(1人) 回复此楼
27楼2011-01-03 15:04:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunyinxue

新虫 (初入文坛)

dock6虚拟筛选中的段错误

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我用dock6做虚拟筛选时提示段错误，怎么办？
赞一下(1人) 回复此楼
28楼2011-01-06 09:45:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

houxuben

木虫 (正式写手)

MEDCHEM03
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
请问dock6.4是否可以实现：依次对多个配体库进行筛选，最后获得一个ranked文件？是有相应的循环脚本？非常感谢
赞一下(1人) 回复此楼
29楼2011-07-23 15:09:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

javacfish

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by houxuben at 2011-07-23 15:09:39:
请问dock6.4是否可以实现：依次对多个配体库进行筛选，最后获得一个ranked文件？是有相应的循环脚本？非常感谢

可以，不需要脚本，设置参数就可以了
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

houxuben
30楼2011-07-24 12:43:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 javacfish 的主题更新
433/5返回列表上一页12345下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[有机交流] 高温高压反应求助 10+4 chibby 2026-03-25 4/200 2026-03-27 21:08 by BT20230424
[考研] 285求调剂 +4 AZMK 2026-03-27 7/350 2026-03-27 20:59 by AZMK
[考研] 学硕274求调剂 +5 Li李鱼 2026-03-26 5/250 2026-03-27 20:51 by 热情沙漠
[考研] 286求调剂 +8 PolarBear11 2026-03-26 8/400 2026-03-27 18:05 by yu221
[考研] 复试调剂，一志愿南农083200食品科学与工程 +5 XQTJZ 2026-03-26 5/250 2026-03-27 14:49 by 狂炫麦当当
[考研] 308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-25 7/350 2026-03-27 14:47 by 狂炫麦当当
[考研] 312求调剂 +9 上岸吧ZJY 2026-03-22 13/650 2026-03-27 11:24 by sanrepian
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +4 崔wj 2026-03-26 4/200 2026-03-27 08:04 by chemisry
[考研] 304材料求调剂 +4 钟llll 2026-03-26 4/200 2026-03-27 03:42 by wxiongid
[考研] 343求调剂 +4 赠我一本书 2026-03-23 4/200 2026-03-27 00:40 by wxiongid
[考研] 085600 材料与化工 329分求调剂 +9 Mr. Z 2026-03-25 9/450 2026-03-26 10:36 by baoball
[考研] 打过很多竞赛，085406控制工程300分，求调剂 +3 askeladz 2026-03-26 3/150 2026-03-26 09:08 by 给你你注意休息
[考研] 299求调剂 +4 15188958825 2026-03-25 4/200 2026-03-25 22:56 by 418490947
[考研] 0854电子信息求调剂 324 +4 Promise-jyl 2026-03-23 4/200 2026-03-25 11:36 by Sugarlight
[考研] 一志愿吉林大学材料与化工303分求调剂 +4 为学666 2026-03-24 4/200 2026-03-25 11:27 by BruceLiu320
[考研] 318求调剂 +3 plum李子 2026-03-23 3/150 2026-03-25 09:42 by 雾散后相遇lc
[考研] 生物学一志愿985，分数349求调剂 +6 zxts12 2026-03-21 9/450 2026-03-23 18:37 by macy2011
[考研] 一志愿华中科技大学071000，求调剂 +4 沿岸有贝壳6 2026-03-21 4/200 2026-03-22 07:21 by ilovexiaobin
[考研] 一志愿东华大学控制学硕320求调剂 +3 Grand777 2026-03-21 3/150 2026-03-21 19:23 by 简之-
[考研] 一志愿深大，0703化学，总分302，求调剂 +4 七月-七七 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:20 by 学员8dgXkO
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭