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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【在线答疑】UCSF DOCK分子对接和虚拟筛选
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zhang360

新虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
希望有详细的教程，网上的教程怎么老是过不去
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41楼2016-07-09 23:16:17
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caiwen28

铜虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
送红花一朵
请问，在用Dock6做对接，如何确定对接口袋位置，

教程上只有   参照复合物中的原配体位置     这一种，
有没有像SYBYL中那样，要选择某些关键氨基酸形成的口袋（里面没有原配体），在DOCK6中如何选择，此时sphere_selector该如何设定使用。

或者有其他的口袋选择方式，

有没有大神知道的。 拜谢！！后续金币奉上。

或相关方向的交流。

（不好意思，相关帖子太少了）
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42楼2016-09-23 17:54:30
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NicoleDH

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
10楼: Originally posted by javacfish at 2010-02-03 19:55:45
郑重声明，我没有分子模拟的注册码，请不要讨论与学术无关的话题。

楼主，你好。我是dock新手，做dock的时候总是出现这样的问题：ERROR:  Could not complete growth.
                                                                                         Confirm that the grid box is large enough to contain the ligand,
                                                                                         and try increasing max_orientations.
请教一下该怎么解决呢？
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你所谓的艰难正是别人出类拔萃的资本。
43楼2017-08-18 10:25:02
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