| 查看: 19591 | 回复: 145 | |||||||||||||
| 【奖励】 本帖被评价112次，作者fanchen021增加金币 91.7001 个 | |||||||||||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||||||||||||
[资源]
【原创】将POSCAR转化为cif文件的一个脚本
|
|||||||||||||
下午看到论坛里有人发布了处理VASP计算结果的程序。我觉得非常好。这里也分享自己写的一个将POSCAR转成cif文件的脚本。 功能：将VASP计算的CONTCAR和POSCAR转成cif文件。后者可以直接用MS软件打开，查看计算构型。 使用方法： 1. 下载附件中的getcif.pl文件，复制到vtstscripts目录下。并确保该目录在环境变量$PATH中。vtstscripts下载见 http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/scripts/ 2. 将脚本文件变成可执行文件。 chmod +x getcif.pl 3. 在VASP工作目录下运行脚本。运行结果会显示凭屏幕上，同时保存在out.cif文件中。 注意事项： 1. 脚本运行需要读取CONTCAR（或POSCAR)和POTCAR文件。其中默认文件名为CONTCAR和POTCAR，即直接输入命令getcif.pl会将CONTCAR中的结构信息转成cif文件。 2. 脚本也支持任意文件名的POSCAR和POTCAR格式的文件。这时需要输入getcif.pl poscarfile（POTCAR文件名仍为默认POTCAR），或getcif.pl poscarfile potcarfile。 查看构型方法： 正确运行脚本后，运行结果会显示在屏幕上， 同时保存在out.cif文件中。这时有两个方法可以在MS中查看构型。 方法一、将out.cif文件导出，用MS软件直接打开即可查看构型。 方法二、在MS软件中新建一个文本文件File->New- > Text，复制屏幕上的输出结果到text文件中，保存后关闭，然后重命名该文件（右击- > Rename)，将后缀名改为cif。这时会弹出一个对话框，询问要不要改后缀名。点击Yes后再打开，即可看到构型。 由于本人的计算需要登陆Linux计算集群，而处理计算结果则是在自己的电脑上（XP系统），因此，用方法二更加方便。大家可以根据自己的实际情况，选择适合自己的方法。 纳米盘下载地址：http://www.namipan.com/d/getcif. ... b5713bca4e7ff040000 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 纳米技术与能源及模拟 | 仿真建模与计算 | 精华网帖收集 | 材料计算模拟实用技巧 |
| 第一性原理 | 研究生资料集 | 第一性原理相关文档 | VASP |
| 第一性原理 | 好东西啊 | MS计算 |
» 猜你喜欢
294求调剂
已经有8人回复
-
324求调剂
已经有14人回复
-
285求调剂
已经有6人回复
-
一志愿上海大学生物学346
已经有3人回复
-
322求调剂：一志愿湖南大学 材料与化工（085600），已过六级。
已经有16人回复
-
调剂
已经有10人回复
-
283求调剂
已经有7人回复
-
0703调剂
已经有6人回复
-
288环境专硕,求调材料方向
已经有6人回复
-
求调剂
已经有5人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- ms转化为 poscar
已经有3人回复
- 求助:怎样把MS输出的.CELL文件输入到VESTA中,并生成POSCAR？
已经有4人回复
- XRD结果和CIF文件之间的关系
已经有10人回复
- cif文件自动转成POSCAR，并固定z轴指定原子脚本
已经有35人回复
- CIF文件导入MS中键出现错误，怎么样解决
已经有11人回复
- 网上Cif 转 POSCAR
已经有4人回复
- 简单且完美的把MS导出的文件转成POSCAR
已经有27人回复
- 有木有人用getcif.pl这个脚本把POSCAR转换为cif文件的
已经有4人回复
- ins.文件能否转换成cif文件 怎么转呢
已经有10人回复
- 测试POSCAR的脚本不运行
已经有10人回复
- cif2pos的更新版本生成的POSCAR和cell文件的结果一致
已经有35人回复
- 【分享】将cif文件直接转成POSCAR文件的小程序cif2poscar
已经有62人回复
- 【求助】如何根据cell文件写poscar
已经有11人回复
- 【前沿】《自然—光子学》：单光子波长转换首次实现
已经有12人回复
- 【分享】处理DOSCAR文件的脚本和程序
已经有19人回复
- 【分享】一个将CASTEP的.cell文件转换为POSCAR的简单脚本
已经有12人回复
- 【转帖】用Material Studio构建复杂模型及转换成poscar的2种方法
已经有56人回复
13楼2009-11-28 01:23:08
