应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物化学 » Nat Methods∣大连化物所
111/1返回列表
查看: 340  |  回复: 10
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

DICP_PELSA

新虫 (初入文坛)

[交流] Nat Methods∣大连化物所

大连化物所生物技术研究部生物分离分析新材料与技术研究组（1809组）叶明亮研究员团队和中国科学院上海药物研究所罗成研究员团队合作，利用蛋白质在结合配体后局部稳定性的变化，开发了一种在复杂体系中可以同时高灵敏鉴定配体结合蛋白和结合位点的蛋白质组学新方法。该方法无需对配体进行化学修饰，广谱适用于包括代谢物、药物、污染物等不同结构配体的靶蛋白质分析。

    研究人员发现，采用大量的胰蛋白酶对自然状态下的蛋白质进行酶切，使之直接产生适合质谱检测的肽段，能够对配体结合引起的局部稳定性变化产生放大作用。基于该发现，研究人员开发了以肽段为中心的蛋白质局部稳定性探测方法（PEptide-centric Local Stability Assay，PELSA），用于配体靶蛋白质的鉴定。PELSA方法无需对配体进行化学修饰、不依赖亲和力大小，直接能在细胞裂解液等复杂样品中发现与配体结合发生局部稳定性变化的蛋白质，从而实现配体结合蛋白质、结合位点以及局部亲和力的系统解析。

    PELSA方法具有较高的鉴定灵敏度，在模型药物星孢菌素靶蛋白的鉴定中，与现有同类的技术（LiP-MS）相比，利用该方法的靶蛋白鉴定灵敏度提高了12倍；与目前广泛使用但缺乏结合位点信息的热蛋白质组技术（TPP）相比，该方法的靶蛋白鉴定灵敏度提高了2.4倍。此外，剂量依赖的PELSA方法可以测定局部亲和力，从而揭示生理状态下蛋白质在结合配体后三维结构的动态变化。研究人员将PELSA方法用于药物、金属离子、翻译后修饰肽段及抗体等多种配体的结合蛋白鉴定，均展现出高灵敏的靶蛋白鉴定性能和精准的结合区域定位能力，证明了PELSA方法可以作为一个通用的分析平台，研究各种配体与蛋白的相互作用。

    由于代谢物种类繁多，结构多样，有些分子结构简单，常以接近细胞生理浓度的亲和力（微摩每升到毫摩每升）与感受蛋白相互作用，二者相互作用的解析长期依赖于生物学家的生物学假设和实验，分析通量有限。本工作开发的PELSA方法非常适合代谢物靶蛋白质的系统鉴定，研究人员利用PELSA方法一次性在HeLa细胞裂解液中鉴定到40个α-酮戊二酸的作用蛋白，其中有30个是大量文献积累的已知作用蛋白，说明该方法靶蛋白鉴定的高灵敏度和高可信度。研究人员进一步将PELSA方法应用于叶酸、亮氨酸、富马酸及琥珀酸等代谢物的作用蛋白鉴定，展示了该方法的广谱适用性。

    本工作开发的PELSA方法在代谢物、药物及污染物的识别及作用机制解析等领域具有广泛的应用价值。

    相关研究成果以“A peptide-centric local stability assay enables proteome-scale identification of the protein targets and binding regions of diverse ligands”为题，于近日发表在《自然-方法》（Nature Methods）上。该工作的第一作者是1809组已毕业博士研究生李柯佳。上述工作得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、大连化物所创新基金等项目的支持。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼2025-02-06 19:19:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
庚辰辛丑2楼
2025-02-06 19:41   回复  
DICP_PELSA(金币+1): 谢谢参与
lymjjh3楼
2025-02-06 20:02   回复  
DICP_PELSA(金币+1): 谢谢参与
tzynew4楼
2025-02-06 20:39   回复  
DICP_PELSA(金币+1): 谢谢参与
k 发自小木虫手机客户端
shenrenren5楼
2025-02-06 21:37   回复  
DICP_PELSA(金币+1): 谢谢参与
psylhh6楼
2025-02-06 22:38   回复  
DICP_PELSA(金币+1): 谢谢参与
miaojiabing7楼
2025-02-07 08:59   回复  
DICP_PELSA(金币+1): 谢谢参与
nono20098楼
2025-02-08 09:43   回复  
DICP_PELSA(金币+1): 谢谢参与
·
tfang9楼
2025-02-08 15:42   回复  
DICP_PELSA(金币+1): 谢谢参与
qhen10楼
2025-02-10 11:01   回复  
DICP_PELSA(金币+1): 谢谢参与
XG-WUST11楼
2025-02-11 18:54   回复  
DICP_PELSA(金币+1): 谢谢参与
up 发自小木虫IOS客户端
相关版块跳转 我要订阅楼主 DICP_PELSA 的主题更新
111/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复(可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 中国计量科学研究院接收调剂研究生 +3 麦烝伟 2025-03-22 4/200 2025-03-22 03:13 by 皮皮在学习
[考研] 可收调剂 +3 Suofeny 2025-03-21 3/150 2025-03-21 23:19 by 小兔子乖乖y
[基金申请] 35了最后一次，把能写的都写上了 +4 云C1oud 2025-03-20 5/250 2025-03-21 20:37 by 云C1oud
[基金申请] RY老师向国内的论文机器们开炮了 +13 zju2000 2025-03-20 22/1100 2025-03-21 19:37 by 瞬息宇宙
[考研] 求调剂 +9 cs0106 2025-03-19 11/550 2025-03-21 18:51 by 嗯嗯amc
[考研] 273求调剂 +6 学员EwRDEL 2025-03-19 8/400 2025-03-21 18:31 by 替代品000
[考研] 08接受跨专业，只求上岸的来 +5 我爱我家，， 2025-03-15 5/250 2025-03-21 18:22 by 妞妞爱学习2025
[考研] 0856材料与化工，总分284，求调剂 +8 wzsr 2025-03-15 8/400 2025-03-21 18:13 by 替代品000
[考研] 是否有材料科学本科专业愿意调剂到机械工程的，请私信 +8 40862026 2025-03-19 8/400 2025-03-21 16:45 by 159316
[考研] 07理学10医学过线调剂来来来 +8 一条上岸鱼鱼鱼 2025-03-19 9/450 2025-03-21 15:56 by 天才朋友
[考研] 化工调剂 +4 我是九月 2025-03-17 5/250 2025-03-20 15:45 by 我是九月
[论文投稿] 研三地理学专业投稿求助 5+3 梨花的瓣子 2025-03-17 5/250 2025-03-20 10:42 by pingfeng00
[考研] 288求调剂 +5 脑瓜子疼! 2025-03-19 5/250 2025-03-20 09:48 by hangyuan13
[考研] 湖南工业大学0856调剂 +17 LLLL1102 2025-03-15 18/900 2025-03-20 01:16 by 131452whh，
[考研] 复试调剂 +4 一只下猫 2025-03-18 4/200 2025-03-20 00:55 by 小小树2024
[基金申请] 我不要你认为 +4 了却无痕 2025-03-19 5/250 2025-03-19 23:58 by xiaochong8693
[考研] 358分求调剂 +6 141389414 2025-03-17 7/350 2025-03-19 17:59 by 141389414
[基金申请] 交了心情賊好 +11 cshyxc 2025-03-16 13/650 2025-03-18 22:21 by kaka_lucky
[考研] 一志愿厦大材料工程085601，312分，本科双非，求调剂 +3 25材料生 2025-03-18 5/250 2025-03-18 21:04 by EBSD
[考博] 申博 or 科研助理 +3 hxying521 2025-03-17 3/150 2025-03-18 00:45 by 鎏鎏白
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭