| 查看: 1111 | 回复: 10 | |||
[交流]
Nat Methods∣大连化物所
|
|||
|
大连化物所生物技术研究部生物分离分析新材料与技术研究组（1809组）叶明亮研究员团队和中国科学院上海药物研究所罗成研究员团队合作，利用蛋白质在结合配体后局部稳定性的变化，开发了一种在复杂体系中可以同时高灵敏鉴定配体结合蛋白和结合位点的蛋白质组学新方法。该方法无需对配体进行化学修饰，广谱适用于包括代谢物、药物、污染物等不同结构配体的靶蛋白质分析。 研究人员发现，采用大量的胰蛋白酶对自然状态下的蛋白质进行酶切，使之直接产生适合质谱检测的肽段，能够对配体结合引起的局部稳定性变化产生放大作用。基于该发现，研究人员开发了以肽段为中心的蛋白质局部稳定性探测方法（PEptide-centric Local Stability Assay，PELSA），用于配体靶蛋白质的鉴定。PELSA方法无需对配体进行化学修饰、不依赖亲和力大小，直接能在细胞裂解液等复杂样品中发现与配体结合发生局部稳定性变化的蛋白质，从而实现配体结合蛋白质、结合位点以及局部亲和力的系统解析。 PELSA方法具有较高的鉴定灵敏度，在模型药物星孢菌素靶蛋白的鉴定中，与现有同类的技术（LiP-MS）相比，利用该方法的靶蛋白鉴定灵敏度提高了12倍；与目前广泛使用但缺乏结合位点信息的热蛋白质组技术（TPP）相比，该方法的靶蛋白鉴定灵敏度提高了2.4倍。此外，剂量依赖的PELSA方法可以测定局部亲和力，从而揭示生理状态下蛋白质在结合配体后三维结构的动态变化。研究人员将PELSA方法用于药物、金属离子、翻译后修饰肽段及抗体等多种配体的结合蛋白鉴定，均展现出高灵敏的靶蛋白鉴定性能和精准的结合区域定位能力，证明了PELSA方法可以作为一个通用的分析平台，研究各种配体与蛋白的相互作用。 由于代谢物种类繁多，结构多样，有些分子结构简单，常以接近细胞生理浓度的亲和力（微摩每升到毫摩每升）与感受蛋白相互作用，二者相互作用的解析长期依赖于生物学家的生物学假设和实验，分析通量有限。本工作开发的PELSA方法非常适合代谢物靶蛋白质的系统鉴定，研究人员利用PELSA方法一次性在HeLa细胞裂解液中鉴定到40个α-酮戊二酸的作用蛋白，其中有30个是大量文献积累的已知作用蛋白，说明该方法靶蛋白鉴定的高灵敏度和高可信度。研究人员进一步将PELSA方法应用于叶酸、亮氨酸、富马酸及琥珀酸等代谢物的作用蛋白鉴定，展示了该方法的广谱适用性。 本工作开发的PELSA方法在代谢物、药物及污染物的识别及作用机制解析等领域具有广泛的应用价值。 相关研究成果以“A peptide-centric local stability assay enables proteome-scale identification of the protein targets and binding regions of diverse ligands”为题，于近日发表在《自然-方法》（Nature Methods）上。该工作的第一作者是1809组已毕业博士研究生李柯佳。上述工作得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、大连化物所创新基金等项目的支持。 |
回复此楼» 猜你喜欢
留学--博士招生
已经有16人回复
-
化学工程，本211，求调剂，ab区不限
已经有4人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有130人回复
-
湖北师范大学招调剂啦
已经有9人回复
-
邵阳学院食品与化学工程学院硕士调剂
已经有0人回复
-
天津商业大学 生物与医药课题组招生
已经有0人回复
-
生物化工学硕招收调剂
已经有0人回复
-
广东石油化工学院2026年硕士研究生需要多名生物，制药工程，食品专业的调剂生
已经有0人回复
-
317分 一志愿江南大学 化学工程学硕 求调剂
已经有6人回复
-
化工申博
已经有3人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
沈阳化工大学环境学院生物技术与工程（无数学）、环境科学与工程等可调剂
+1/481
-
陕科大环境学院招收0857和0830调剂考生【可跨门类，最后2两小时】
+1/186
-
接收材料科学与工程和化学专业学硕调剂-西南科大辐射防护材料
+3/107
-
山东航空学院安全工程专业085702第三轮接收研究生调剂，欢迎咨询
+1/94
-
中山大学邵晓剑课题组招收博士后（化学生物学、蛋白质组学、环境毒理学）
+1/79
-
汕头大学硕士研究生调剂
+2/50
-
大连工业大学 高分子材料 接收考研调剂
+1/18
-
佛山大学 动物科技学院 畜牧 欢迎广大学子报考！
+1/15
-
南华大学资源与环境接受调剂，专业特色：“核”环保，有机会进入核相关企业工作。
+1/10
-
河南农业大学理学院招收化学（学硕）和材料与化工（专硕）专业硕士调剂生2名
+1/10
-
~【西昌学院资源与环境学院硕士招生调剂】~
+1/9
-
鲁东大学水产学院，水产学硕接收调剂3-4人
+1/7
-
齐齐哈尔大学李莉课题组诚招2026级考研调剂生（学硕和专硕）
+1/5
-
0854,0858调剂招生
+1/5
-
哈尔滨医科大学李老师课题组招收生物信息学方向博士、硕士研究生
+1/4
-
鲁东大学水产学院杨建敏教授课题组，2026年水产学硕接收调剂3-4人
+1/4
-
浙江科技大学 招 高分子材料背景调剂生
+1/3
-
河北大学招收等离子体物理调剂生
+1/2
-
丽水学院材能学院-先进能源存储与器件课题组-26届研究生招生-（新能源电池方向）
+1/2
-
线上复试：河南理工大学 化工学院 接收调剂硕士研究生
+1/2
简单回复
庚辰辛丑2楼
2025-02-06 19:41
回复
DICP_PELSA(金币+1): 谢谢参与
lymjjh3楼
2025-02-06 20:02
回复
DICP_PELSA(金币+1): 谢谢参与
tzynew4楼
2025-02-06 20:39
回复
DICP_PELSA(金币+1): 谢谢参与
k 发自小木虫手机客户端
2025-02-06 21:37
回复
DICP_PELSA(金币+1): 谢谢参与
psylhh6楼
2025-02-06 22:38
回复
DICP_PELSA(金币+1): 谢谢参与
2025-02-07 08:59
回复
DICP_PELSA(金币+1): 谢谢参与
nono20098楼
2025-02-08 09:43
回复
DICP_PELSA(金币+1): 谢谢参与
·
tfang9楼
2025-02-08 15:42
回复
DICP_PELSA(金币+1): 谢谢参与
qhen10楼
2025-02-10 11:01
回复
DICP_PELSA(金币+1): 谢谢参与
XG-WUST11楼
2025-02-11 18:54
回复
DICP_PELSA(金币+1): 谢谢参与
up 发自小木虫IOS客户端
